More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1017 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1017  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  754    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  44.64 
 
 		 380 aa  288  9e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  33.33 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  33.95 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  31.02 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  32.16 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  34.25 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2749  ABC-type transport system, permease component  37.46 
 
 		 386 aa  189  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  32.38 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  34.7 
 
 		 382 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  32.16 
 
 		 382 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  29.91 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  30.21 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  32.33 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5557  putative ABC transporter (permease protein)  32.6 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.6 
 
 		 384 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  31.4 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03183  ABC transporter permease  34.03 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  31.87 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0373  hypothetical protein  32.13 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  28.73 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  33.24 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  27.3 
 
 		 367 aa  179  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1915  ABC transporter permease  38.43 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22680  putative permease of ABC transporter  37.65 
 
 		 381 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590843 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  37.5 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  38.82 
 
 		 377 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  35.21 
 
 		 376 aa  176  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  32.04 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  30.21 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  29.95 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  32.05 
 
 		 430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  30.16 
 
 		 368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  31.91 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2637  hypothetical protein  40.64 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  31.13 
 
 		 378 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  32.97 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  32.38 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  31.55 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  32.93 
 
 		 378 aa  169  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  30.79 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0160  hypothetical protein  32.81 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  32.27 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  32.83 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  31.51 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  30.39 
 
 		 378 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  30.4 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2414  hypothetical protein  38.83 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.77995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  28.75 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  27.91 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.36 
 
 		 369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  30.38 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  28.37 
 
 		 373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  29.84 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0038  protein of unknown function DUF140  37.55 
 
 		 381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1839  hypothetical protein  29.33 
 
 		 376 aa  162  7e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  30.18 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  32.56 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  30 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  28.74 
 
 		 366 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1074  hypothetical protein  28.8 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  28.74 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  29.35 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  29.74 
 
 		 382 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  31.18 
 
 		 371 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4113  hypothetical protein  32.87 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  36.44 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  32.97 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  31.34 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3668  hypothetical protein  29.54 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0702453 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1058  protein of unknown function DUF140  36.4 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00141261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  30.68 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  41.95 
 
 		 266 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0670  hypothetical protein  33.82 
 
 		 369 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1540  hypothetical protein  30.71 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1962  hypothetical protein  33.7 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  38 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  31.09 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2445  hypothetical protein  36.47 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  30.68 
 
 		 382 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1985  ABC transporter permease protein  35.62 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  28.95 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4961  protein of unknown function DUF140  31.96 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.77669  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  30.88 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  27.88 
 
 		 374 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  27.88 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  35.78 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  32.1 
 
 		 374 aa  143  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  28.07 
 
 		 374 aa  142  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  30.2 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  36.76 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  37.25 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  39.23 
 
 		 264 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  26.9 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3136  hypothetical protein  36.24 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>