252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1015 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0466  Mammalian cell entry related domain protein  36.01 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2751  paraquat-inducible ABC-type transporter, periplasmic component  30.12 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4623  hypothetical protein  27.16 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  25.8 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1496  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.024979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  21.52 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  27.44 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1320  Mammalian cell entry related domain protein  25.14 
 
 		 337 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  26.76 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.16 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  25.16 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1072  hypothetical protein  23.69 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2635  hypothetical protein  30.88 
 
 		 328 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  32.22 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  26.32 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  25.77 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  23.82 
 
 		 310 aa  79  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  23.83 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  27.57 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  25.21 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  29.33 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  27.38 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3015  hypothetical protein  31.55 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.231252  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  24.06 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.07 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  27.34 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3376  hypothetical protein  24.52 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166606  normal  0.0325483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  24.46 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  32.98 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2416  hypothetical protein  25.08 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  24.48 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0021  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component-like  23.86 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2447  hypothetical protein  29.84 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.18 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  26.53 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  26.26 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  27.48 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  24.12 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  24.4 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.82 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  27.48 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  26.26 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  25.73 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  24.35 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  22.94 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  22.26 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3809  Mammalian cell entry related domain protein  26.17 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  26.64 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  22.68 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  27.78 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1990  paraquat-inducible protein B  23.62 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2638  paraquat-inducible protein B  23.62 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2549  paraquat-inducible protein B  23.62 
 
 		 550 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0824615  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0363  paraquat-inducible protein B  23.74 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  26.23 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1794  paraquat-inducible protein B  24.18 
 
 		 555 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.63 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3499  hypothetical protein  25.51 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2067  paraquat-inducible protein B  23.05 
 
 		 546 aa  60.8  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2722  paraquat-inducible protein B  25 
 
 		 550 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1652  paraquat-inducible protein B  24.48 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  26 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3138  hypothetical protein  37.31 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.448864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  23.69 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3509  fibronectin, type III  22.86 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.736082  normal  0.990532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  26.8 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.49 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1983  hypothetical protein  24.67 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.042136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2074  hypothetical protein  26.82 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0955309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1683  paraquat-inducible protein B  23.61 
 
 		 548 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1230  Mammalian cell entry related domain protein  25.09 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.16167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  23.56 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4853  paraquat-inducible protein B  22.02 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0366  paraquat-inducible protein B  22.31 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.838729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  35.4 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0040  Mammalian cell entry related domain protein  23.62 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  35.4 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  21.63 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  27.71 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  25.17 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2366  paraquat-inducible protein B  22.86 
 
 		 546 aa  57  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  31.03 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  26.1 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1056  Mammalian cell entry related domain protein  26.09 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  24.25 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  24.2 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2692  Mammalian cell entry related domain protein  22.45 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000610454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1115  paraquat-inducible protein B  22.45 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000291875  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0064  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.702785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3199  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0433  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2645  paraquat-inducible protein B  22.45 
 
 		 546 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000298494  hitchhiker  0.00000476211 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0452  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.81 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>