19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0956 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0956  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1223    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.194018  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3258  hypothetical protein  27.58 
 
 
930 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339134  normal  0.438308 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4520  hypothetical protein  28.16 
 
 
541 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0874605  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1697  hypothetical protein  30.12 
 
 
360 aa  101  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.874269  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1706  hypothetical protein  27.98 
 
 
370 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3124  hypothetical protein  29.32 
 
 
361 aa  94  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.507339  hitchhiker  0.000432102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3336  hypothetical protein  28.32 
 
 
396 aa  94  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7052  hypothetical protein  29.34 
 
 
373 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0057  hypothetical protein  33.07 
 
 
482 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.185735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1790  hypothetical protein  28.08 
 
 
384 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1491  hypothetical protein  31.03 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0526  hypothetical protein  26.97 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4615  hypothetical protein  29.92 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2768  hypothetical protein  26.21 
 
 
361 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.580688  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2835  hypothetical protein  28.51 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995862  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0622  hypothetical protein  25.58 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0908  hypothetical protein  25.96 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0413158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2312  hypothetical protein  23.9 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.243961  normal  0.498174 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0234  hypothetical protein  26.44 
 
 
326 aa  58.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>