More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0946 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  66.9 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3164  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 		 142 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0732563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 144 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 144 aa  177  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  65.62 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  176  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 144 aa  176  9e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  62.79 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  62.79 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  173  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 150 aa  173  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2877  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 144 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000267326  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2707  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613136  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3666  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000138225  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2696  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 154 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0952933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  170  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  60.58 
 
 		 143 aa  169  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 144 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0292  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000415233  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  55 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  58.57 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  168  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1873  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0461  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797457  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 		 142 aa  167  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  55 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  168  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1812  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 149 aa  167  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.181539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  57.45 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>