18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0927 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  320  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2809  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00265973  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0429  zinc-resistance associated protein  32.56 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4493  zinc resistance protein  30.19 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00866025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3992  zinc resistance-associated protein  30.19 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03879  Zn-binding periplasmic protein  30.19 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03832  hypothetical protein  30.19 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.149166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4236  zinc resistance protein  30.19 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4545  zinc resistance protein  30.19 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.104922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5471  zinc resistance protein  30.19 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.465059  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4023  zinc resistance protein  30.19 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62288  normal  0.0161925 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4450  zinc resistance protein  31.13 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.353323  hitchhiker  0.00183369 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1805  hypothetical protein  29.23 
 
 
217 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2909  zinc resistance protein  27.93 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2822  zinc resistance protein  28.15 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2945  hypothetical protein  27.12 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2711  hypothetical protein  26.03 
 
 
157 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0015  zinc resistance-associated protein  28 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.893884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>