More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0842 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  31.41 
 
 		 2350 aa  672    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2831 aa  5724    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  47.39 
 
 		 1763 aa  1380    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  58.24 
 
 		 2961 aa  2269    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 3073 aa  321  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  28.17 
 
 		 2387 aa  262  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  45.58 
 
 		 1351 aa  247  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  44.2 
 
 		 1030 aa  243  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1750 aa  195  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4064  YD repeat-containing protein  57.29 
 
 		 201 aa  193  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000373929  normal  0.364165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 		 850 aa  189  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  41.67 
 
 		 892 aa  174  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  37.57 
 
 		 772 aa  169  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.35 
 
 		 1599 aa  162  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1352 aa  156  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  38.31 
 
 		 1051 aa  149  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1942 aa  149  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1271 aa  149  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  34.94 
 
 		 623 aa  147  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  29.89 
 
 		 741 aa  146  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1669 aa  146  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  27.2 
 
 		 1917 aa  145  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.33 
 
 		 1130 aa  143  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 3193 aa  139  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1840 aa  139  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 		 807 aa  139  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  25.43 
 
 		 2096 aa  139  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1600 aa  139  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31 
 
 		 963 aa  136  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  28.19 
 
 		 788 aa  134  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  28.19 
 
 		 788 aa  134  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.86 
 
 		 1568 aa  130  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  34.52 
 
 		 719 aa  130  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1959 aa  129  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.57 
 
 		 2296 aa  127  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  37.74 
 
 		 646 aa  127  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1026 aa  125  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.83 
 
 		 1572 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1611 aa  124  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.82 
 
 		 1614 aa  123  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.71 
 
 		 439 aa  122  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  35.31 
 
 		 863 aa  121  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  27.1 
 
 		 764 aa  120  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 		 732 aa  120  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.32 
 
 		 1509 aa  120  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.39 
 
 		 693 aa  119  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  28.25 
 
 		 1595 aa  119  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1400 aa  119  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  26.63 
 
 		 678 aa  119  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  35.41 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.82 
 
 		 1576 aa  119  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  28.25 
 
 		 1586 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 756 aa  118  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.64 
 
 		 924 aa  118  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  23.7 
 
 		 1385 aa  117  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  28.8 
 
 		 705 aa  117  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.29 
 
 		 2277 aa  117  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.42 
 
 		 2225 aa  117  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.9 
 
 		 738 aa  116  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  25.61 
 
 		 1488 aa  115  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.6 
 
 		 1489 aa  115  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1558 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.29 
 
 		 2003 aa  115  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.88 
 
 		 2149 aa  115  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.32 
 
 		 2035 aa  114  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1411 aa  112  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.14 
 
 		 1292 aa  110  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.04 
 
 		 690 aa  110  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.01 
 
 		 1673 aa  110  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.48 
 
 		 866 aa  109  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.85 
 
 		 903 aa  109  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.07 
 
 		 3027 aa  109  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.97 
 
 		 1530 aa  109  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1409 aa  108  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 2294 aa  108  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 869 aa  109  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  24.59 
 
 		 1679 aa  108  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 		 770 aa  108  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1531 aa  108  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 927 aa  108  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  23.28 
 
 		 1616 aa  107  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.7 
 
 		 2246 aa  107  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1379 aa  107  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  37.3 
 
 		 1046 aa  106  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  24.92 
 
 		 2221 aa  105  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1953 aa  105  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  22.7 
 
 		 1639 aa  105  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  23.7 
 
 		 1437 aa  105  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.28 
 
 		 1485 aa  105  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1505 aa  104  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1467 aa  105  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  30.85 
 
 		 1916 aa  104  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  24.88 
 
 		 2178 aa  103  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.21 
 
 		 1518 aa  103  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.51 
 
 		 1541 aa  103  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.15 
 
 		 1384 aa  103  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 1495 aa  103  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1935 aa  102  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  34.58 
 
 		 451 aa  102  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1541 aa  102  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>