More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0834 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  100 
 
 		 300 aa  596  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  48.79 
 
 		 294 aa  288  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  47.75 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  53.58 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  47.72 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  50.18 
 
 		 294 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 290 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  48.42 
 
 		 294 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.88 
 
 		 294 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  46.92 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  47.75 
 
 		 290 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  47.4 
 
 		 290 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  45.52 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  45.52 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  43.94 
 
 		 289 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  44.14 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  46.98 
 
 		 293 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  36.93 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  40.21 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  34.14 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  34.83 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  36.43 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.4 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 338 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  35.41 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 316 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.48 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.48 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 297 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.48 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  32.69 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.37 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  32.37 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.37 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.01 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  31.01 
 
 		 293 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 292 aa  148  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.05 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.43 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.33 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  30.95 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.22 
 
 		 299 aa  146  5e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 301 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  31.33 
 
 		 302 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.93 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  29.39 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>