71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0803 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0803  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 		 152 aa  299  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  31.43 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2587  Fis family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.325398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  25.71 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.46 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  35.09 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.85 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  27.07 
 
 		 264 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.17 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6067  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.06 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.635989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  25 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.19 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2183  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.56 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  25.35 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  32.43 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.76 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  25.66 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2190  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.22 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.91 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0598  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.28 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.47 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.91 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  24.29 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  24.29 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.43 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  25.35 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.77 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  23.33 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.78 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  24.65 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  29.69 
 
 		 413 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  27.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  25.69 
 
 		 157 aa  42  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  24.29 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  26.43 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0749  ATP synthase F0, B subunit  27.55 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246986  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  33.87 
 
 		 238 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  37.25 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  24.75 
 
 		 278 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  26.28 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  30.66 
 
 		 168 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.17 
 
 		 259 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.19 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  23.65 
 
 		 141 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  22.3 
 
 		 141 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>