More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0768 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0768  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  800    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1051  hypothetical protein  41.54 
 
 
390 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1783  hypothetical protein  37.46 
 
 
386 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1734  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.96 
 
 
385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.02 
 
 
722 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  36.14 
 
 
703 aa  238  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.95 
 
 
698 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  36.14 
 
 
703 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  9e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
703 aa  232  9e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  35.84 
 
 
629 aa  232  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  35.54 
 
 
703 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  35.54 
 
 
703 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.25 
 
 
713 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.45 
 
 
699 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  38.18 
 
 
730 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  37.88 
 
 
727 aa  226  6e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  36.28 
 
 
720 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0971  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.04 
 
 
723 aa  222  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2267  hypothetical protein  34.66 
 
 
692 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00913496  hitchhiker  0.0000724137 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0968  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.2 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.405818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1446  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.55 
 
 
383 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2808  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.38 
 
 
383 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  34.85 
 
 
752 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  37.76 
 
 
720 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0042  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.51 
 
 
738 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2065  hypothetical protein  34.15 
 
 
658 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.810314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0461  hypothetical protein  33.75 
 
 
703 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.667458  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.86 
 
 
676 aa  207  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3824  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.66 
 
 
728 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.676113  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1707  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.08 
 
 
737 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.121804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  35 
 
 
716 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0570  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.95 
 
 
655 aa  202  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0837064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  35.63 
 
 
699 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.13 
 
 
717 aa  202  9e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.51 
 
 
721 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  34.23 
 
 
716 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.28 
 
 
774 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  31.88 
 
 
1388 aa  199  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  32.74 
 
 
1033 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2785  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.02 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.21 
 
 
737 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3765  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.23 
 
 
712 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0441363  normal  0.184331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1468  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.02 
 
 
656 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  34.13 
 
 
732 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  33.23 
 
 
1027 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1417  hypothetical protein  33.58 
 
 
688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  33.83 
 
 
718 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1359  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.75 
 
 
658 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.548906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2255  hypothetical protein  33.23 
 
 
655 aa  195  9e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000010012  hitchhiker  0.0000000000013579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2925  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.44 
 
 
658 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.9 
 
 
387 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2714  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.12 
 
 
664 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.793769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1502  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.12 
 
 
664 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0009  hypothetical protein  33.64 
 
 
678 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  31.5 
 
 
727 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0685  hypothetical protein  32.62 
 
 
659 aa  193  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808103  normal  0.989456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.94 
 
 
686 aa  192  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1213  hypothetical protein  30.96 
 
 
661 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.3 
 
 
694 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.54 
 
 
743 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  33.23 
 
 
739 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  29.91 
 
 
678 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.53 
 
 
683 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2414  hypothetical protein  31.89 
 
 
652 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  32.46 
 
 
1044 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.43 
 
 
762 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1527  hypothetical protein  31.68 
 
 
654 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0501  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.99 
 
 
724 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.17587  normal  0.555543 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.43 
 
 
699 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2087  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.69 
 
 
663 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.371437  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.46 
 
 
629 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0933  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.95 
 
 
695 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271519  normal  0.676616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  33.04 
 
 
1046 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  33.04 
 
 
1042 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  33.04 
 
 
1046 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.71 
 
 
679 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31 
 
 
694 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.94 
 
 
737 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2795  iron-sulfur cluster-binding protein  31.58 
 
 
661 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.623048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.36 
 
 
748 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  32.54 
 
 
989 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  34.22 
 
 
762 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.03 
 
 
758 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  33.02 
 
 
711 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.02 
 
 
711 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0739  hypothetical protein  32.29 
 
 
639 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.778114  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.99 
 
 
1131 aa  179  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2367  hypothetical protein  33.84 
 
 
683 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2131  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.78 
 
 
663 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.72 
 
 
711 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 
671 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  33.43 
 
 
615 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.55 
 
 
632 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  34.85 
 
 
631 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  37.42 
 
 
632 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>