More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0755 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  358  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000803052  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0422  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  72.73 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0312726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  67.5 
 
 		 124 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  66.67 
 
 		 125 aa  177  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  66.67 
 
 		 124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  67.52 
 
 		 123 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  64.17 
 
 		 129 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  65.12 
 
 		 149 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.33 
 
 		 138 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  66.39 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  56.55 
 
 		 144 aa  167  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  58.39 
 
 		 144 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  62.5 
 
 		 129 aa  167  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  58.39 
 
 		 142 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.1 
 
 		 127 aa  165  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  61.34 
 
 		 131 aa  164  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  64.1 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  57.45 
 
 		 143 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  60.16 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  63.56 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  57.6 
 
 		 150 aa  153  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  59.84 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1416  nitrogen-fixing NifU-like  58.47 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000796101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  62.3 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  55.56 
 
 		 146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  61.42 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.59 
 
 		 283 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  56.1 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.48 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3202  nitrogen fixation protein  60.94 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0956766  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.09 
 
 		 284 aa  141  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.37 
 
 		 211 aa  140  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.08 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2712  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.56 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.1157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  59.32 
 
 		 291 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  59.32 
 
 		 291 aa  137  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.31 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.02 
 
 		 281 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  53.72 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.08 
 
 		 309 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0653  NifU domain-containing protein  54.24 
 
 		 163 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000132683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1409  NifU-like domain-containing protein  48.82 
 
 		 131 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.817294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  58.97 
 
 		 280 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  53.39 
 
 		 312 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0835  NifU domain-containing protein  46.61 
 
 		 127 aa  131  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0951  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.08 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  52 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  50.39 
 
 		 128 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_822  NifU domain protein  45.83 
 
 		 127 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.85 
 
 		 278 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2904  scaffold protein  50.39 
 
 		 128 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.146516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  48.84 
 
 		 128 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  49.61 
 
 		 128 aa  127  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.85 
 
 		 298 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1947  NifU domain-containing protein  49.14 
 
 		 133 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3061  scaffold protein  51.16 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  unclonable  0.000000668017 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  50.39 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.39 
 
 		 277 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0282  scaffold protein  50.39 
 
 		 127 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2750  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.39 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0248  scaffold protein  51.2 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1245  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969333  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3030  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.1 
 
 		 281 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0674  FeS cluster assembly scaffold protein IscU  46.72 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.589513  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0823  FeS cluster assembly scaffold IscU  46.72 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0640926  normal  0.782754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1630  scaffold protein  51.54 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00319481  hitchhiker  0.000018396 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  51.13 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3626  scaffold protein  48.06 
 
 		 128 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.284747  normal  0.811196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2162  scaffold protein  51.2 
 
 		 135 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.789596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2035  scaffold protein  51.2 
 
 		 135 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  49.63 
 
 		 135 aa  124  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  55.93 
 
 		 288 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  51.59 
 
 		 127 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  50.79 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  0.0000000193406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.23 
 
 		 281 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1300  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.129436  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2578  scaffold protein  50.4 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.115419  hitchhiker  0.00110358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1554  scaffold protein  47.79 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1145  scaffold protein  51.2 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.133708 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0470  FeS cluster assembly scaffold IscU  48.84 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0220387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14740  scaffold protein  50 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1457  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.4 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1876  scaffold protein  50.4 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.473661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2605  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.41 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000897774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>