More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0730 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  67.74 
 
 		 124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 126 aa  166  7e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 122 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  64.8 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.64 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  64.46 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  69.23 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  61.11 
 
 		 126 aa  163  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  64.96 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  63.25 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.98 
 
 		 121 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  62.39 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 123 aa  159  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  59.06 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  58.4 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 123 aa  157  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  65.29 
 
 		 121 aa  158  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 125 aa  156  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  58.27 
 
 		 124 aa  155  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  64.1 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  62.93 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 121 aa  154  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 122 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.33 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  62.28 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  54.76 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 120 aa  151  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 124 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  58.27 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  58.82 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  58.82 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 126 aa  150  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.68 
 
 		 124 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 121 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  61.86 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  57.48 
 
 		 127 aa  147  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  146  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  57.6 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>