More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0711 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1558  50S ribosomal protein L2  68.5 
 
 		 273 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  68.36 
 
 		 274 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  64.47 
 
 		 277 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  66.06 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  67.27 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  68 
 
 		 274 aa  371  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  67.64 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64.62 
 
 		 276 aa  368  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  64.36 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  66.18 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  64.98 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  65.82 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  65.34 
 
 		 276 aa  366  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  66.55 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  68.5 
 
 		 273 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  64.98 
 
 		 276 aa  361  8e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  64 
 
 		 279 aa  360  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 275 aa  360  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  65.58 
 
 		 276 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  63.27 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 276 aa  355  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  64.6 
 
 		 275 aa  354  8.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1848  50S ribosomal protein L2  65.45 
 
 		 279 aa  354  8.999999999999999e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 275 aa  353  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2061  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 279 aa  353  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000364134  normal  0.142265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  67.88 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 274 aa  352  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 276 aa  352  5e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  63.9 
 
 		 276 aa  349  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  66.3 
 
 		 275 aa  348  5e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  64.49 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  66.16 
 
 		 274 aa  348  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  348  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  63.64 
 
 		 275 aa  348  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  63 
 
 		 273 aa  346  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1914  50S ribosomal protein L2  63.5 
 
 		 282 aa  345  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253672 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 277 aa  344  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  63.04 
 
 		 277 aa  344  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  60.87 
 
 		 276 aa  343  2e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1943  50S ribosomal protein L2  62.77 
 
 		 282 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 276 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1936  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 282 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2021  50S ribosomal protein L2  62.41 
 
 		 282 aa  341  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  64.89 
 
 		 282 aa  341  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.37 
 
 		 276 aa  341  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 275 aa  340  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 274 aa  338  4e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0492  50S ribosomal protein L2  60.73 
 
 		 275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000323805  hitchhiker  0.00406555 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  63.54 
 
 		 276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0292  50S ribosomal protein L2  66.28 
 
 		 264 aa  335  5e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0294  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 278 aa  334  7e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  3.4720999999999997e-28 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0487  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 275 aa  334  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000349566  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0429  50S ribosomal protein L2  60.07 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000081496  decreased coverage  0.00000678891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  61.45 
 
 		 276 aa  334  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 279 aa  333  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 274 aa  332  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2420  50S ribosomal protein L2  65.89 
 
 		 264 aa  332  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00126121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  57.76 
 
 		 283 aa  331  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 277 aa  330  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0477  50S ribosomal protein L2  60.22 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0481332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  60 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0845  ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 276 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0454  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 274 aa  328  4e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000232989  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  58.76 
 
 		 280 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4002  ribosomal protein L2  62.91 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.712064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  59.27 
 
 		 275 aa  327  1.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2643  50S ribosomal protein L2  63.77 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.331406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  64.13 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  61.62 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_420  ribosomal protein L2  59.49 
 
 		 274 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00663414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  59.64 
 
 		 273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2226  50S ribosomal protein L2  64.73 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000549007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>