More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0704 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 123 aa  243  9e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 123 aa  219  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 127 aa  213  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  212  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  213  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 127 aa  211  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 136 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  210  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  210  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  210  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 124 aa  210  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  210  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  207  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  207  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 135 aa  206  7e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  205  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  204  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  203  5e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 124 aa  204  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 129 aa  204  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  203  6e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  81.15 
 
 		 123 aa  203  8e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  202  9e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  202  1e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  202  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  202  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  201  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  201  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  201  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  80.99 
 
 		 123 aa  201  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  73.72 
 
 		 140 aa  200  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  200  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 125 aa  200  7e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  81.82 
 
 		 122 aa  199  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  198  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  76.23 
 
 		 134 aa  197  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 123 aa  197  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 139 aa  197  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  197  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  78.51 
 
 		 135 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2174  ribosomal protein S12  79.67 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.123269  normal  0.537249 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 125 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  80.17 
 
 		 122 aa  197  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  78.05 
 
 		 124 aa  196  6e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  75.61 
 
 		 124 aa  197  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  197  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 126 aa  196  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  196  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>