More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0699 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  100 
 
 		 234 aa  463  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  63.09 
 
 		 234 aa  308  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 		 233 aa  304  7e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  64.09 
 
 		 233 aa  297  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  62.67 
 
 		 234 aa  296  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  62.22 
 
 		 233 aa  296  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  61.33 
 
 		 234 aa  295  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2075  ribosomal protein L1  59.83 
 
 		 234 aa  292  4e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  61.82 
 
 		 233 aa  289  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  61.36 
 
 		 233 aa  287  9e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 231 aa  284  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  58.93 
 
 		 233 aa  277  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 234 aa  276  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 231 aa  276  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  58.41 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  56.95 
 
 		 235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  55.11 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 235 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  54.42 
 
 		 235 aa  271  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 231 aa  267  8.999999999999999e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 235 aa  267  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  55.17 
 
 		 233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 229 aa  265  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1452  50S ribosomal protein L1  57.39 
 
 		 235 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 232 aa  264  7e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  52.32 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 229 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 231 aa  259  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  53.62 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  54.82 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 230 aa  258  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  53.64 
 
 		 229 aa  255  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  56.4 
 
 		 234 aa  255  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0442  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 235 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  56.83 
 
 		 230 aa  254  8e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2224  50S ribosomal protein L1  56.4 
 
 		 234 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.009605 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.45 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  52.65 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 230 aa  251  8.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 233 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0592  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0784244  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  50.43 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  50 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  52.25 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  53.54 
 
 		 259 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  52.73 
 
 		 236 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1399  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 232 aa  244  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  51.11 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  52.44 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  51.53 
 
 		 236 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 233 aa  243  3e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00040  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 229 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 236 aa  241  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  54.09 
 
 		 229 aa  241  6e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0301  50S ribosomal protein L1  49.38 
 
 		 242 aa  241  6e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000226656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  53.77 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  52 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 235 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1965  50S ribosomal protein L1  54.55 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0834753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  55.11 
 
 		 229 aa  238  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_002950  PG0391  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  49.15 
 
 		 237 aa  238  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  52.07 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>