More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0694 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 595 aa  1226    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.49 
 
 		 617 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.98 
 
 		 534 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  36.48 
 
 		 539 aa  240  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  33.41 
 
 		 547 aa  240  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  35.97 
 
 		 620 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.2 
 
 		 515 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  35.54 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  33.57 
 
 		 495 aa  231  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  35.04 
 
 		 498 aa  231  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.25 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  31.29 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 550 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  31.92 
 
 		 554 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  33.63 
 
 		 544 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  34.82 
 
 		 556 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  32.44 
 
 		 511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 580 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.18 
 
 		 527 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  34.66 
 
 		 638 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.71 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  34.22 
 
 		 546 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  32.33 
 
 		 552 aa  207  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  30.92 
 
 		 661 aa  207  7e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  32 
 
 		 543 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  32.44 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.9 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  32.66 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  32.75 
 
 		 733 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  28.25 
 
 		 618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  32.39 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  31.78 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  32.82 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  32.74 
 
 		 476 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  35.73 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0489  Lytic transglycosylase catalytic  33.16 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000573639 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  32.74 
 
 		 476 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  29.75 
 
 		 587 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  32.45 
 
 		 519 aa  194  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  33.25 
 
 		 544 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 517 aa  193  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  30.8 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  30.86 
 
 		 524 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  31.81 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 518 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3789  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  31.98 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  32.59 
 
 		 515 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  32.74 
 
 		 515 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  32.59 
 
 		 515 aa  190  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  33.15 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0472  lytic transglycosylase catalytic protein  32.67 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  32.81 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  33.26 
 
 		 612 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.26 
 
 		 612 aa  188  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 527 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2744  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 448 aa  187  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.42143e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 539 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  30.75 
 
 		 517 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  32.21 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3846  Lytic transglycosylase catalytic  31.9 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  31.31 
 
 		 479 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.56 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2556  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic  33.51 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000626959  hitchhiker  0.0000000459399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  33.94 
 
 		 495 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  31.1 
 
 		 519 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  31.1 
 
 		 515 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0393  lytic transglycosylase, catalytic  32.01 
 
 		 498 aa  180  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00582053  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  29.27 
 
 		 498 aa  180  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  31.1 
 
 		 515 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3932  Lytic transglycosylase catalytic  31.49 
 
 		 573 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  31.1 
 
 		 515 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  30.6 
 
 		 570 aa  179  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0380  Lytic transglycosylase catalytic  29.61 
 
 		 555 aa  178  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  31.51 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  28.42 
 
 		 523 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  31.51 
 
 		 499 aa  177  6e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  32.01 
 
 		 506 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.04 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  31.89 
 
 		 501 aa  176  9e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  30.71 
 
 		 447 aa  176  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  32.05 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  31.26 
 
 		 570 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.04 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  26.26 
 
 		 610 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  32.55 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.41 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.41 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  28.37 
 
 		 650 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.41 
 
 		 395 aa  171  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  31.29 
 
 		 464 aa  171  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  35.22 
 
 		 377 aa  170  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  30.4 
 
 		 522 aa  170  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  31.72 
 
 		 531 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  33.7 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.518176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  31.81 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>