179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0651 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0651  sucrose phosphorylase  100 
 
 		 482 aa  997    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0824794  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0241  Sucrose phosphorylase  49.15 
 
 		 483 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1779  glycosidase  48.77 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1542  sucrose phosphorylase  47.15 
 
 		 485 aa  471  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.296567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0384  glycosidase  47.45 
 
 		 492 aa  460  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00983965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0232  sucrose phosphorylase  39.42 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.528502  normal  0.696528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0061  sucrose phosphorylase  37.29 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0065  sucrose phosphorylase  36.98 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4288  sucrose phosphorylase  36.98 
 
 		 492 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00965772  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0066  sucrose phosphorylase  37.08 
 
 		 492 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.530318  hitchhiker  0.00316152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0062  sucrose phosphorylase  37.24 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0945971  unclonable  0.0000350237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0066  sucrose phosphorylase  37.03 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000218626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0064  sucrose phosphorylase  37.03 
 
 		 494 aa  340  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000722293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3361  alpha amylase catalytic region  41.84 
 
 		 491 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01971  sucrose phosphorylase  38.92 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1331  sucrose phosphorylase  37.76 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00201506  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3990  sucrose phosphorylase  37.67 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00149762  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3029  alpha amylase catalytic subunit  30.18 
 
 		 556 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.172997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1248  alpha amylase catalytic region  30.51 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3210  sucrose phosphorylase  29.52 
 
 		 596 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02161  putative sucrose phosphorylase  28.1 
 
 		 584 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2600  sucrose phosphorylase  28.6 
 
 		 591 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0436867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0774  Alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 589 aa  171  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1771  alpha amylase catalytic region  26.55 
 
 		 585 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0665  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 		 555 aa  168  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.694695  normal  0.614349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0418  alpha amylase, catalytic region  29.15 
 
 		 577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.537622  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2164  alpha amylase, catalytic region  29.68 
 
 		 586 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.659302  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2566  alpha amylase, catalytic region  27.59 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0104089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2573  alpha amylase, catalytic region  27.59 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000337914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2580  alpha amylase, catalytic region  27.59 
 
 		 578 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.008896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1424  alpha amylase family protein  27.05 
 
 		 559 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2337  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 559 aa  163  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01286  predicted glucosyltransferase  27.05 
 
 		 559 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1519  alpha amylase family protein  27.05 
 
 		 559 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2316  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 559 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.278573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1813  alpha amylase family protein  26.83 
 
 		 559 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.653374 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0506  putative sucrose phosphorylase  27.88 
 
 		 544 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2588  alpha amylase  29.23 
 
 		 598 aa  155  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2165  alpha amylase, catalytic region  26.39 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1523  alpha amylase catalytic region  26.74 
 
 		 561 aa  149  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.346384  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1824  putative sucrose phosphorylase  27.64 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.552548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10441  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 589 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2846  alpha amylase, catalytic region  25.94 
 
 		 581 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.218279  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0246  alpha amylase domain-containing protein  25.6 
 
 		 583 aa  140  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09141  glycoside hydrolase family protein  25.32 
 
 		 583 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264002 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08951  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 586 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.497034  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0838  alpha amylase domain-containing protein  25.83 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2243  alpha amylase domain-containing protein  25.29 
 
 		 575 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08971  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 		 586 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.540308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2606  alpha amylase domain-containing protein  25.52 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06751  glycoside hydrolase family protein  24.34 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.335085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  26.19 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 667 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  28.72 
 
 		 636 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  28.8 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  22.75 
 
 		 638 aa  69.7  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  21.58 
 
 		 661 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0833  alpha-glucosidase  29.8 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2158  alpha amylase catalytic region  30.3 
 
 		 542 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  23.94 
 
 		 646 aa  66.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  22.52 
 
 		 643 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  28.34 
 
 		 650 aa  65.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  26.99 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  25.84 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  28.34 
 
 		 645 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  27.75 
 
 		 642 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 652 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  25.13 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  24.83 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3603  alpha amylase catalytic region  27.8 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3038  alpha amylase, catalytic region  27.24 
 
 		 568 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  27.89 
 
 		 672 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  28.12 
 
 		 638 aa  58.9  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0695  alpha amylase catalytic region  28.28 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.497083 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  27.08 
 
 		 650 aa  57  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  23.47 
 
 		 1099 aa  57  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1739  alpha amylase catalytic region  27.92 
 
 		 550 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12260  glycosidase  27.46 
 
 		 563 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203639  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  24.69 
 
 		 1098 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3302  alpha amylase catalytic region  26.94 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15105  normal  0.0149256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1883  alpha amylase catalytic region  27.03 
 
 		 538 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.681572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3357  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.925027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 639 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3700  alpha amylase catalytic region  29.35 
 
 		 560 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  22.49 
 
 		 650 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  23.89 
 
 		 1094 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1529  alpha amylase catalytic region  24.12 
 
 		 593 aa  54.3  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.331611  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  25.1 
 
 		 1098 aa  54.3  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  25.65 
 
 		 1123 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  24.05 
 
 		 1116 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  23.66 
 
 		 1116 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2746  alpha amylase catalytic region  27.46 
 
 		 570 aa  53.9  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00507625 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2164  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 571 aa  53.5  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126804  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  24.43 
 
 		 1100 aa  53.5  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13840  glycosidase  27.14 
 
 		 605 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3300  alpha amylase catalytic region  27.08 
 
 		 560 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.522775  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  23.42 
 
 		 1130 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5316  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0561676  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08990  glycosidase  26.56 
 
 		 570 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.134217  normal  0.0194138 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51470  Alpha-glucosidase  26.15 
 
 		 565 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>