24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0646 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1004  hypothetical protein  35.87 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0131469 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0826  hypothetical protein  32.32 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  30.21 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  36.59 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  29.36 
 
 
113 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  29.35 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  32.95 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  34.15 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  27.17 
 
 
98 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2341  hypothetical protein  31.13 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  27.08 
 
 
109 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  29.47 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  26.37 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1389  hypothetical protein  26.8 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00337403  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2909  hypothetical protein  23.4 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3187  hypothetical protein  23.4 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.670946  normal  0.123063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0759  hypothetical protein  29.63 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0505  hypothetical protein  23.4 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  25.26 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  25.26 
 
 
129 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  27.63 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  27.27 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1087  hypothetical protein  24.51 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>