115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0614 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0614  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2406  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2365  Radical SAM domain protein  35.76 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1314  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.147685  hitchhiker  0.000205505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3275  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.86 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3435  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.37 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.02 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2352  radical SAM family protein  27.17 
 
 		 487 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 389 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 406 aa  53.9  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1807  radical SAM family protein  28.39 
 
 		 465 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0681457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 406 aa  53.5  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4646  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.27 
 
 		 397 aa  53.1  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 471 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.42 
 
 		 464 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.95 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0089  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 569 aa  52.4  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.63352  normal  0.503154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1728  hypothetical protein  24.3 
 
 		 491 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  25 
 
 		 445 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  28.91 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1809  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 578 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.335774  normal  0.27889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.87 
 
 		 349 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 400 aa  50.8  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1446  radical SAM domain-containing protein  28.87 
 
 		 573 aa  50.8  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1938  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 727 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3420  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.22 
 
 		 506 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.53604  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1813  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 442 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.07 
 
 		 390 aa  49.7  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2494  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 407 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1470  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 445 aa  49.7  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  32.17 
 
 		 459 aa  49.3  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1009  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 573 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.209169  hitchhiker  0.0000165729 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1003  radical SAM domain-containing protein  32.76 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3162  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3141  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2082  radical SAM family protein  24.5 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.460163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 394 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 446 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1889  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  28.15 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0574  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.983421  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1639  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 579 aa  47  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 364 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 401 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.76 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  20.47 
 
 		 323 aa  46.6  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  24.62 
 
 		 404 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.79 
 
 		 325 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  25.38 
 
 		 375 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 405 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 418 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0931  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 436 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.996122  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 428 aa  46.2  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.97 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  22.16 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  24.8 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  22.35 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.83 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.66 
 
 		 394 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.73 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.2 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  23.63 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  22.54 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.69 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.63 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1106  radical SAM family protein  25.59 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2160  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.93 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.921473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 404 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 414 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>