More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0596 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 368 aa  723    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  50.42 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  51.12 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  51.12 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  50.69 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  49.44 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  48.48 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  46.89 
 
 		 366 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  48.06 
 
 		 373 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  47.78 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  45.58 
 
 		 371 aa  285  8e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  48.33 
 
 		 373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  47.77 
 
 		 373 aa  282  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  42.11 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  43.57 
 
 		 373 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  45.23 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  41.8 
 
 		 382 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  47.8 
 
 		 371 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  43.01 
 
 		 373 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  40.06 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  42.11 
 
 		 370 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 373 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0992  rod shape-determining protein RodA  43.85 
 
 		 371 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0276003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  42.51 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2824  rod shape-determining protein RodA  45.13 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.806923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  42.06 
 
 		 368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  43.4 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  43.86 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  39.89 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  42.47 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3360  rod shape-determining protein RodA  43.85 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132084  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  42.74 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  41.96 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  41.96 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  41.69 
 
 		 367 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  42.63 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2188  rod shape-determining protein RodA  45.13 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0470446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  40.59 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  43.16 
 
 		 368 aa  251  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  44.15 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  39.84 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  40.48 
 
 		 364 aa  250  4e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  40.17 
 
 		 370 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  38.34 
 
 		 379 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  41.94 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  42.39 
 
 		 379 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  40.9 
 
 		 366 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  42.86 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  41.49 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  41.96 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  42.23 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  42.23 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  42.23 
 
 		 368 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  43.4 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  41.47 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  41.74 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  43.93 
 
 		 376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  38.78 
 
 		 369 aa  244  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  40.95 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  39.89 
 
 		 370 aa  242  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2218  rod shape-determining protein RodA  43.01 
 
 		 373 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0522  rod shape-determining protein RodA  42.35 
 
 		 372 aa  242  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.886192  hitchhiker  0.00122393 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  46.52 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  40.86 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  45.32 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  40.86 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  36.8 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  42.9 
 
 		 376 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4364  cell cycle protein  45.13 
 
 		 381 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  45.13 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4969  rod shape-determining protein RodA  45.29 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  46.04 
 
 		 382 aa  236  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  41.18 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  44.14 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  41.51 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  42.32 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  45.42 
 
 		 370 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  44.02 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  45.08 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  45.08 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  40.58 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  45.59 
 
 		 380 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  39.5 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  37.7 
 
 		 372 aa  232  6e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  43.59 
 
 		 380 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  44.64 
 
 		 361 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  42.56 
 
 		 412 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>