More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0565 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  100 
 
 		 428 aa  834    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  63.81 
 
 		 429 aa  556  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  60.19 
 
 		 431 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  63.55 
 
 		 438 aa  504  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  57.73 
 
 		 457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  59.13 
 
 		 434 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  57.84 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  55.95 
 
 		 444 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  56.76 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  55.66 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  54.48 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  54.63 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  52.06 
 
 		 433 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0959  ammonium transporter  55.16 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  53.43 
 
 		 410 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  53.68 
 
 		 410 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  53.19 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0994  ammonium transporter  53.1 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.540241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  401  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  52.7 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  54.48 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  52.94 
 
 		 410 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  52.7 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  53.32 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  53.28 
 
 		 449 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0641  ammonium transporter  52.74 
 
 		 416 aa  396  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.117335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  54.19 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  52.62 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  54.19 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  50.99 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  51.88 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  51.81 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  51.81 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2784  ammonium transporter  53.5 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  51.81 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  51.57 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  51.81 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  51.81 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  50.37 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  51.81 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  51.81 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  53.98 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  51.37 
 
 		 397 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1182  ammonium transporter  49.52 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000100846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6194  ammonium transporter  51.31 
 
 		 504 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  50.93 
 
 		 488 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0257  ammonium transporter  50.6 
 
 		 501 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2065  ammonium transporter  49.88 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000790161  normal  0.636143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  51.24 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0526  ammonium transporter  52.05 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  53.96 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1917  ammonium transporter  51.7 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3537  ammonium transporter  48.96 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.945825  decreased coverage  0.00000925998 
 
 
-
 
NC_004310  BR1896  ammonium transporter  56.16 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.786334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3728  ammonium transporter  48.96 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  49.43 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0438  ammonium transporter  51.08 
 
 		 500 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.481032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4189  ammonium transporter  51.08 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.793194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47780  Ammonium transporter  54.78 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0706  ammonium transporter  48.73 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2876  ammonium transporter  50.84 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601179  normal  0.287688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  50.36 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2251  ammonium transporter  50.84 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112232  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  51.38 
 
 		 397 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  51.88 
 
 		 459 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2865  ammonium transporter  50.84 
 
 		 500 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00160968  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3605  ammonium transporter  48.5 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  50.59 
 
 		 489 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2589  ammonium transporter  52 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  52.58 
 
 		 408 aa  374  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  48.78 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  52.58 
 
 		 408 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  47.24 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  50.23 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  52.21 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  50.23 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  51.84 
 
 		 408 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  50.35 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1101  ammonium transporter  47.68 
 
 		 432 aa  365  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.991152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3160  ammonium transporter  48.56 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0807  ammonium transporter  48.56 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0778  ammonium transporter  49.04 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  51.28 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1688  ammonium transporter  50.25 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  50 
 
 		 515 aa  364  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0270  ammonium transporter  52.7 
 
 		 433 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  47.71 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2782  ammonium transporter  51.08 
 
 		 503 aa  363  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0900246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  52.21 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2920  ammonium transporter  51.08 
 
 		 497 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617737  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6029  ammonium transporter  53.21 
 
 		 442 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0694  ammonium transporter  49.88 
 
 		 452 aa  362  8e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0866  ammonium transporter  52.84 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.366572 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69795  ammonium transporter AmtB  53.21 
 
 		 442 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.25807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  49.5 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0239  ammonium transporter  53.67 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.050651  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0241  ammonium transporter  52.42 
 
 		 468 aa  359  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5505  ammonium transporter  51.49 
 
 		 445 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.698175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>