18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0544 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0544  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  36.92 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  35.38 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  32.81 
 
 
300 aa  50.4  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3330  hypothetical protein  33.8 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  32.81 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  31.25 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  36.67 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  35.94 
 
 
155 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  30.77 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  32.31 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  34.43 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  34.43 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  34.43 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  30 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  31.82 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1621  hypothetical protein  32.81 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.238182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0095  Zn-ribbon-containing protein  25.71 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>