More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0535 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0535  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
321 aa  666    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0868  ribonuclease BN  50.47 
 
 
318 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0960  glycosyl transferase family protein  44.73 
 
 
316 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3161  glycosyl transferase family protein  45.25 
 
 
316 aa  261  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.23698  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.04 
 
 
528 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2495  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 
343 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  41.99 
 
 
531 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1129  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
351 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3273  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
365 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0196  glycosyl transferase family protein  45.74 
 
 
298 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000720605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5070  glycosyl transferase family 2  48.74 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0480  glycosyl transferase family 2  37.99 
 
 
410 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5183  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
352 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3015  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
458 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2041  glycosyl transferase family 2  38.37 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3753  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  40.22 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4065  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 
338 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2417  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 
346 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0634  glycosyl transferase family 2  35 
 
 
332 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.289574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5930  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3501  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
330 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.137120000000001e-33 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2018  glycosyl transferase family protein  45.81 
 
 
391 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
230 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
344 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
230 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
230 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
229 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
232 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
340 aa  105  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
340 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
230 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
336 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  35.75 
 
 
245 aa  102  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
242 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
287 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
242 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  33.81 
 
 
237 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
242 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
355 aa  99  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  32.34 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.86 
 
 
247 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  34.83 
 
 
245 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.82 
 
 
248 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
245 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.82 
 
 
241 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
242 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  30.08 
 
 
261 aa  95.9  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
448 aa  95.5  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
228 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  30 
 
 
234 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
362 aa  95.1  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0121  b-glycosyltransferase  28.44 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  28.85 
 
 
247 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
313 aa  94  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
245 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 
340 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
293 aa  92  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
243 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  31.34 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
261 aa  90.9  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
229 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.28 
 
 
238 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6508  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
246 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000357167  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5753  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
246 aa  89.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1870  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
246 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00880451  normal  0.0336485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.87 
 
 
246 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.21 
 
 
244 aa  89.4  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
321 aa  89  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  34.69 
 
 
299 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
229 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
301 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
271 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
246 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
257 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.27 
 
 
809 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
227 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.41 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1295  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
269 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
395 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
262 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.38 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
450 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1323  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
247 aa  86.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000286825  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.61 
 
 
321 aa  85.9  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12088  polyprenol-monophosphomannose synthase ppm1  28.45 
 
 
874 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000628532  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1974  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.12 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.696678  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1612  glycosyl transferase family protein  32.94 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
252 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0345  dolichol-phosphate mannosyltransferase  26.47 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.855294  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4051  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
251 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0554  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.23 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>