More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0472 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  100 
 
 
356 aa  733  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.57905e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  61.41 
 
 
356 aa  464  1e-130  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  60.4 
 
 
355 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1713  peptide chain release factor 1  62.04 
 
 
355 aa  450  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0456393  normal  0.957916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  58.54 
 
 
355 aa  447  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  61.52 
 
 
356 aa  447  1e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  59.38 
 
 
357 aa  441  1e-122  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  4.16881e-11  hitchhiker  3.05481e-10 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  59.38 
 
 
356 aa  438  1e-122  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  59.26 
 
 
356 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  9.63425e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3709  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 
359 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.231674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
358 aa  431  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.38678e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
358 aa  431  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.02063e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  58.31 
 
 
355 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.69919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 
355 aa  433  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  1.00734e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  58.52 
 
 
355 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  58.87 
 
 
355 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.06535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  56.86 
 
 
355 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  1.04378e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3804  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 
359 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 
355 aa  433  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.28855e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
358 aa  431  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  3.28302e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2647  peptide chain release factor 1  58.97 
 
 
354 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00109947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 
358 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.02201e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  58.4 
 
 
357 aa  429  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4061  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
355 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.677357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  59.72 
 
 
355 aa  429  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  5.09235e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  57.18 
 
 
355 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  4.88952e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
360 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  3.28118e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  56.9 
 
 
358 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  2.10571e-09  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  58.19 
 
 
353 aa  424  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  57.67 
 
 
360 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  7.99175e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2299  peptide chain release factor 1  56.98 
 
 
356 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  57.22 
 
 
359 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0064  peptide chain release factor 1  57.75 
 
 
355 aa  415  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  7.29315e-09  hitchhiker  0.00306425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0255  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
359 aa  415  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.018292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  57.46 
 
 
358 aa  416  1e-115  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.42042e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0094  peptide chain release factor 1  59.32 
 
 
356 aa  417  1e-115  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.494548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  58.07 
 
 
355 aa  417  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1071  peptide chain release factor 1  56.09 
 
 
355 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.471814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  56.3 
 
 
357 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  57.71 
 
 
361 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2984  peptide chain release factor 1  55.84 
 
 
357 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0805  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
367 aa  398  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0675137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3435  peptide chain release factor 1  58.94 
 
 
358 aa  399  1e-110  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  54.39 
 
 
363 aa  401  1e-110  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2593  peptide chain release factor 1  55.56 
 
 
360 aa  401  1e-110  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.61971e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  58.03 
 
 
357 aa  399  1e-110  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1725  peptide chain release factor 1  56.37 
 
 
358 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00127994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  61.76 
 
 
355 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  3.18273e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2489  peptide chain release factor 1  53.8 
 
 
361 aa  395  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1805  peptide chain release factor 1  54.93 
 
 
355 aa  391  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0117611  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
361 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 
358 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.01474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  53.54 
 
 
361 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.99484e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2493  peptide chain release factor 1  55.27 
 
 
360 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  54.7 
 
 
360 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3201  peptide chain release factor 1  54.6 
 
 
360 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
361 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  53.39 
 
 
355 aa  391  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2474  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
360 aa  388  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0389  peptide chain release factor 1  50 
 
 
363 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2192  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 
358 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.267751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0980  peptide chain release factor 1  56.61 
 
 
360 aa  388  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  5.72262e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2154  peptide chain release factor 1  54.96 
 
 
358 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.659693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 
370 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0366  peptide chain release factor 1  51.55 
 
 
370 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  51.27 
 
 
370 aa  384  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17970  peptide chain release factor 1  53.65 
 
 
358 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.77535e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 
360 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
360 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
360 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4104  peptide chain release factor 1  50 
 
 
357 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
372 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  53.28 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2309  peptide chain release factor 1  51.98 
 
 
358 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.321803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2721  peptide chain release factor 1  52.99 
 
 
360 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2780  peptide chain release factor 1  57.58 
 
 
356 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.014775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  52.71 
 
 
360 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2566  peptide chain release factor 1  54.02 
 
 
363 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0384672  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3706  peptide chain release factor 1  50.28 
 
 
359 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0488544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 
363 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3590  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.637465  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0676  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
360 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0972  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
360 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3614  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.528922  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1943  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
360 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.640725  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0740  peptide chain release factor 1  53.52 
 
 
355 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.759458  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0452  peptide chain release factor 1  50.99 
 
 
362 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02573  peptide chain release factor 1  52.87 
 
 
361 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263327  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0440  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2641  peptide chain release factor 1  53.56 
 
 
358 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3603  peptide chain release factor 1  53.69 
 
 
360 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0414  peptide chain release factor 1  52.14 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.592527  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0504  peptide chain release factor 1  53.41 
 
 
360 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  52.42 
 
 
360 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>