151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0399 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 357 aa  738    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  28.33 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.06 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.54 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.89 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 408 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  28.7 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.14 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  23.9 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3779  putative monooxygenase, FAD/NAD(P)-binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  22.12 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  22.77 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.04 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  23.59 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 384 aa  57  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.05 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.71 
 
 		 446 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4192  FAD-dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 564 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  26.48 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  24.59 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 403 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.33 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  22.58 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  23.5 
 
 		 378 aa  53.1  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  30 
 
 		 445 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.71 
 
 		 445 aa  53.1  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1109  monooxygenase FAD-binding  32 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.529688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.33 
 
 		 446 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  22.31 
 
 		 385 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  35.14 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.07 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.34 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  35.14 
 
 		 405 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1385  monooxygenase FAD-binding  34.48 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2592  monooxygenase, FAD-binding  30.2 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.61 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  32.65 
 
 		 407 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4068  salicylyl-CoA 5-hydroxylase  27.41 
 
 		 790 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.76 
 
 		 468 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  22.93 
 
 		 379 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4888  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.46 
 
 		 776 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1224  monooxygenase FAD-binding  33.79 
 
 		 413 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0821266  normal  0.977549 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  22.4 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0313  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.71 
 
 		 430 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.800751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0893  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.35 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  22.9 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 362 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  22.45 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.97 
 
 		 407 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  24.65 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 418 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  32.43 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  24.62 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0875  FAD-dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 581 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.474503  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.04 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  22.25 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  22.86 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  22.19 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  30.61 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  28.16 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 367 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.27 
 
 		 449 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5482  monooxygenase, FAD-binding  27.49 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.942938  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.65 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  25.32 
 
 		 443 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 457 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 393 aa  47  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 424 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 368 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  24.69 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1298  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>