127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0346 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  309  7.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  34.72 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  33.59 
 
 		 158 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  29.84 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  29.84 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 751 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  34.65 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  30.71 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2693  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.37 
 
 		 616 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  28.68 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  30.23 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  27.27 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  29.93 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  30.28 
 
 		 162 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  30.58 
 
 		 200 aa  67  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  28.68 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3345  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.77 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.17 
 
 		 907 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  31.5 
 
 		 245 aa  64.7  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3187  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.37 
 
 		 474 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  31.5 
 
 		 181 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  27.81 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  29.8 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  30 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  28.91 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  25.15 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  27.14 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  23.97 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1959  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.1 
 
 		 413 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3369  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  29.1 
 
 		 432 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000232864  unclonable  2.00404e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1812  NLP/P60 family protein  28.36 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000382267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1988  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.36 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.1332199999999997e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1787  NLP/P60 family protein  28.36 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1769  NLP/P60 family protein  28.24 
 
 		 420 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000165376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1952  NLP/P60 family protein  28.36 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000344583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  25.18 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2037  NLP/P60 family protein  28.36 
 
 		 426 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000532667  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2059  putative cell wall peptidase, NlpC/P60 family  28.36 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000850665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1493  NLP/P60 protein  27.61 
 
 		 418 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000786314  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  25.95 
 
 		 556 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  28.8 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0477  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.4 
 
 		 377 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  27.2 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  28.05 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  30.25 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  25.53 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  43.4 
 
 		 370 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  25.62 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  27.2 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  25.98 
 
 		 239 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1821  NLP/P60 protein  25.74 
 
 		 430 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000102093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  21.9 
 
 		 532 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  28 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  24.8 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  23.08 
 
 		 532 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  30.39 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  30.97 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2128  NLP/P60 protein  27.54 
 
 		 235 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00187925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  23.85 
 
 		 536 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0006  bacteriocin  28.99 
 
 		 1067 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.1 
 
 		 476 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  29.71 
 
 		 564 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  28.95 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.19 
 
 		 553 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  23.12 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5027  NLP/P60 protein  26.62 
 
 		 578 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000376094  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  25.76 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4915  cell wall hydrolase; N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.39 
 
 		 580 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  9.30619e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5353  enterotoxin  25 
 
 		 582 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000381193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5324  enterotoxin  26.39 
 
 		 598 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.216360000000001e-60 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  35.59 
 
 		 184 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  28.99 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  27.54 
 
 		 564 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  28.99 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  27.54 
 
 		 564 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase; enterotoxin  25.18 
 
 		 579 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000272032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0462  SH3 type 3 domain-containing protein  26.15 
 
 		 1751 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5468 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5406  putative cell wall hydrolase  25.45 
 
 		 582 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  26.4 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5357  putative cell wall hydrolase  24.48 
 
 		 577 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5603  putative cell wall hydrolase  25.56 
 
 		 582 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000253963  unclonable  5.14343e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3768  NLP/P60 protein  24.81 
 
 		 575 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000116427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.27 
 
 		 1284 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  25.76 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  29.3 
 
 		 382 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.09 
 
 		 1776 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2077  cell wall hydrolase/autolysin  26.19 
 
 		 333 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  22.22 
 
 		 773 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  30.77 
 
 		 197 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  30.77 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2620  L-alanyl-D-glutamate peptidase  27.94 
 
 		 281 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000189687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>