More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0342 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0342  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 237 aa  487  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.087099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2676  ferric uptake regulator family protein  38.4 
 
 		 148 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  36.69 
 
 		 143 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  36.09 
 
 		 143 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  33.58 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  39.02 
 
 		 144 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  34.53 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1564  ferric uptake regulator family protein  34.03 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0495536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  34.59 
 
 		 152 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  33.81 
 
 		 143 aa  98.6  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2388  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 167 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2300  ferric uptake regulator, Fur family  34.11 
 
 		 167 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  32.85 
 
 		 147 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0753  ferric uptake regulator family protein  40 
 
 		 144 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 143 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  33.83 
 
 		 143 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2251  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409228  normal  0.662099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  32.59 
 
 		 154 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0449  ferric uptake regulation protein  32.17 
 
 		 157 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.270092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0423  ferric uptake regulation protein  32.17 
 
 		 157 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00356258  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1557  ferric uptake regulation protein  32.17 
 
 		 157 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.754844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0459  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 143 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00576361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0592  FUR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.311415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  31.16 
 
 		 164 aa  85.9  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2147  ferric uptake regulation protein  33.11 
 
 		 155 aa  85.5  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000154091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0520  transcriptional regulator, Fur family  30.83 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000515951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0505  FUR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0448  ferric uptake regulator  30.83 
 
 		 144 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0444  ferric uptake regulator  30.83 
 
 		 144 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0593  transcriptional regulator, Fur family  30.83 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000040057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0537  FUR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  85.1  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00799734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0542  transcriptional regulator, Fur family  30.83 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0453  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.964373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4784  transcriptional regulator, Fur family  30.83 
 
 		 142 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000324074  hitchhiker  0.00000172777 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 165 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3367  ferric uptake regulator family protein  31.11 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  32.43 
 
 		 155 aa  84.3  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  33.04 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1143  ferric uptake regulation protein  30.82 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0587945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0842  ferric uptake regulator, Fur family  27.14 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1084  ferric uptake regulator, Fur family  33.61 
 
 		 144 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.784641  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  32.2 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3806  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0159  ferric uptake regulator, Fur family  30.83 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  34.81 
 
 		 143 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  28.28 
 
 		 159 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1645  ferric uptake regulation protein (ferric uptake regulator)  29.37 
 
 		 155 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1194  ferric-uptake regulator  39.68 
 
 		 159 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  31.36 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  33.62 
 
 		 145 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  28.57 
 
 		 150 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  29.58 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7263  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0956308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 150 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  37.5 
 
 		 140 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  38.21 
 
 		 148 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2373  ferric uptake regulator, Fur family  35.58 
 
 		 154 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000416204 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3863  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199126  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3949  ferric uptake regulator, Fur family  29.85 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.234293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0061  zinc uptake regulator  34.78 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  36.59 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  30.87 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2638  zinc uptake regulator  30.65 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  32.79 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0291  ferric uptake regulator family protein  39.25 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.420841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  32.85 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  37.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2730  ferric uptake regulator family protein  34.78 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3924  ferric uptake regulator family protein  29.93 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.567476 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  33.91 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0577  ferric-uptake regulator  30.5 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  29.46 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0487  ferric uptake regulation protein  27.74 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1272  ferric uptake regulator family protein  33.81 
 
 		 158 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3767  ferric uptake regulator family protein  31.16 
 
 		 140 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  35.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  33.9 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  35.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  31.93 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  35.92 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2066  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.779744  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  32.52 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  35.83 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  36.89 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1451  ferric uptake regulation protein  39.64 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000060196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  35.71 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>