More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0240 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0240  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
753 aa  1568    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1305  AAA ATPase central domain protein  32.41 
 
 
731 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.596818  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  34.21 
 
 
573 aa  345  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  28.38 
 
 
711 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  30.27 
 
 
773 aa  209  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  29.81 
 
 
771 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  29.11 
 
 
773 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  29.2 
 
 
698 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  28.91 
 
 
775 aa  194  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0165  AAA ATPase, central region  28.63 
 
 
672 aa  192  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  28.07 
 
 
766 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  28.64 
 
 
771 aa  189  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  27.75 
 
 
772 aa  189  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  26.64 
 
 
795 aa  180  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  28.16 
 
 
789 aa  180  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  28.74 
 
 
789 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  26.95 
 
 
655 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4244  AAA ATPase, central region  29.56 
 
 
686 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000108013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0729  AAA ATPase, central region  29.14 
 
 
668 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.562949  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3219  ATPase central domain-containing protein  27.91 
 
 
680 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100242 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0877  conserved hypothetical protein, putative ATPase, AAA family  27.63 
 
 
640 aa  149  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.144041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3885  AAA family ATPase  27.82 
 
 
680 aa  146  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  27.44 
 
 
676 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3559  ATPase central domain-containing protein  28.24 
 
 
677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  31.16 
 
 
478 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  28.26 
 
 
725 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  26.71 
 
 
743 aa  92  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  36.53 
 
 
656 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  37.84 
 
 
578 aa  89  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  36.07 
 
 
577 aa  88.6  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  32.29 
 
 
617 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  35.67 
 
 
580 aa  87.4  9e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  36 
 
 
134 aa  87.4  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  37.23 
 
 
570 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  38.18 
 
 
665 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  37.23 
 
 
570 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  37.23 
 
 
570 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  39.24 
 
 
639 aa  87.4  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  37.4 
 
 
570 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  33.18 
 
 
657 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  35.71 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  37.59 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  30.17 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  31.58 
 
 
442 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2115  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.89 
 
 
731 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0683  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.81 
 
 
731 aa  83.6  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  25.24 
 
 
713 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  39.39 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  32.68 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  29.11 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.77 
 
 
754 aa  81.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  41.54 
 
 
656 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.04 
 
 
754 aa  81.3  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  35.77 
 
 
754 aa  81.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  35.88 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  29.87 
 
 
662 aa  81.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  37.5 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2346  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.21 
 
 
731 aa  80.1  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.654531  hitchhiker  0.00924894 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0500  AAA family ATPase  31.25 
 
 
351 aa  79.7  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0781793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  24.02 
 
 
787 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  32.7 
 
 
367 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  33.55 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  34.01 
 
 
434 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  34.97 
 
 
697 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  26.12 
 
 
739 aa  78.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  36.18 
 
 
450 aa  79  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1983  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.29 
 
 
731 aa  78.2  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1075  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.18 
 
 
738 aa  78.2  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.106296  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  31.68 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  32.32 
 
 
305 aa  77  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  36.15 
 
 
754 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  22.57 
 
 
763 aa  75.9  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.24 
 
 
732 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  34.87 
 
 
781 aa  75.5  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  33.12 
 
 
239 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  37.6 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  30.82 
 
 
355 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.69 
 
 
757 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.88 
 
 
719 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  22.35 
 
 
756 aa  75.5  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  23.1 
 
 
810 aa  74.7  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  26.72 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.12 
 
 
739 aa  74.7  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  25.25 
 
 
699 aa  74.3  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  24.33 
 
 
768 aa  74.3  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  35.51 
 
 
756 aa  74.3  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  36.29 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  31.21 
 
 
1193 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  28.09 
 
 
697 aa  73.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.24 
 
 
753 aa  74.3  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.36 
 
 
808 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  37.9 
 
 
363 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  28.74 
 
 
360 aa  73.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  27.54 
 
 
1085 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  26.89 
 
 
466 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.38 
 
 
723 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0194  AAA ATPase central domain protein  37.9 
 
 
691 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.122239  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.14 
 
 
387 aa  73.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.3 
 
 
718 aa  72.8  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>