46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0201 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  100 
 
 		 884 aa  1806    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2911  hypothetical protein  24.53 
 
 		 833 aa  90.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0559  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.3 
 
 		 832 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2772  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.51 
 
 		 853 aa  65.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000415237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.35 
 
 		 863 aa  63.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  31.94 
 
 		 483 aa  60.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  29.56 
 
 		 459 aa  60.1  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  27.67 
 
 		 462 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  29.85 
 
 		 432 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  26.25 
 
 		 464 aa  55.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  27.46 
 
 		 483 aa  54.3  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1649  hypothetical protein  34.83 
 
 		 522 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  30.69 
 
 		 459 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0733  hypothetical protein  36.84 
 
 		 531 aa  53.5  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  30.61 
 
 		 501 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3116  hypothetical protein  32 
 
 		 514 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0200817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 527 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  33.15 
 
 		 523 aa  52.4  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2363  hypothetical protein  34 
 
 		 522 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5512  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1486 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.96 
 
 		 530 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  26.56 
 
 		 414 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  29.09 
 
 		 454 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.34 
 
 		 479 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  26.45 
 
 		 454 aa  49.7  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  28.57 
 
 		 450 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  31.43 
 
 		 505 aa  49.3  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  32.43 
 
 		 457 aa  49.3  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  30.41 
 
 		 558 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  32.28 
 
 		 536 aa  48.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  32.05 
 
 		 442 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  26.15 
 
 		 465 aa  47.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1933  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1003 aa  47.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  29.05 
 
 		 466 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0693  polymorphic membrane protein A family protein  27.07 
 
 		 986 aa  47  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  29.07 
 
 		 454 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  30.7 
 
 		 489 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  27.8 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.41 
 
 		 934 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  32.19 
 
 		 435 aa  45.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  28 
 
 		 775 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.88 
 
 		 575 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2767  parallel beta-helix repeat-containing protein  25 
 
 		 326 aa  44.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  33.61 
 
 		 362 aa  44.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  25.4 
 
 		 575 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  32.39 
 
 		 1755 aa  44.3  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>