More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0184 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  689    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 197 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 221 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 190 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 206 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 217 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  23.71 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  31.36 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 220 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 222 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  26.28 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 229 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 195 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 233 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  35.82 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  28.28 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 201 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  20.53 
 
 		 225 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  20.81 
 
 		 206 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 216 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>