More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0160 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  278  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  40.52 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  33.58 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  33.85 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  39.51 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  31.78 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  36.36 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  32.58 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  33.85 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  30.77 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  34.07 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  41.03 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  38.27 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.5 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.26 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.71 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  32.06 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.29 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.43 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.58 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  33.08 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.21 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  25.78 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  26.81 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  30.07 
 
 		 317 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  30.53 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  29.79 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.95 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.94 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  34.53 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  34.43 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  25.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  29.08 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.21 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  27.86 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  27.59 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  28.68 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  45.1 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  28.99 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.81 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  47.83 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  29.93 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.69 
 
 		 415 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1509  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.41 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.767189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  45.1 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  26.09 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  31.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  31.39 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0806  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0671262  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  31.25 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.2 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  29.32 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  29.23 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  31.21 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.78 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  25.53 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  35.56 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  26.95 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  30.23 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  30 
 
 		 301 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  31.25 
 
 		 283 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0027  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  23.36 
 
 		 207 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  46 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  32.09 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29 
 
 		 217 aa  50.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_27  Na+/H+ antiporter C-terminal domain/universal stress protein-like protein  30.66 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.547805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  30.71 
 
 		 279 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.78 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.37 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0028  universal stress protein  30.66 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.406249  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.28 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  26.87 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.15 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.36 
 
 		 288 aa  50.1  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>