227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0097 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
817 aa  1678  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  48.28 
 
 
842 aa  674  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  3.26362e-11 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 
842 aa  686  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.98698e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  48.29 
 
 
812 aa  656  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  44.82 
 
 
828 aa  645  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 
826 aa  667  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  47.33 
 
 
836 aa  640  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  45.17 
 
 
828 aa  632  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  44.17 
 
 
828 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  45.21 
 
 
849 aa  602  1e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  43.15 
 
 
898 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.87 
 
 
860 aa  592  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  47.43 
 
 
633 aa  578  1e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  44.08 
 
 
852 aa  578  1e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  45.96 
 
 
624 aa  574  1e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
898 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
898 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  42.78 
 
 
842 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  44.68 
 
 
614 aa  564  1e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  43.45 
 
 
897 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  45.79 
 
 
618 aa  555  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  44.75 
 
 
613 aa  553  1e-156  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  41.37 
 
 
897 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  47.3 
 
 
626 aa  551  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 
864 aa  546  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  44.79 
 
 
638 aa  543  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  46.48 
 
 
619 aa  539  1e-152  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  44.59 
 
 
617 aa  538  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  47.29 
 
 
619 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
617 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
617 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
628 aa  528  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  45 
 
 
613 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  44.04 
 
 
626 aa  525  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.19843e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  44.59 
 
 
599 aa  497  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 
610 aa  497  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  44.43 
 
 
599 aa  496  1e-138  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  43.83 
 
 
611 aa  495  1e-138  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 
627 aa  489  1e-136  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  41.54 
 
 
655 aa  476  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
654 aa  479  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  44.41 
 
 
971 aa  479  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 
657 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  41.29 
 
 
636 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.81 
 
 
644 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  42.04 
 
 
640 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  41.81 
 
 
597 aa  472  1e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  41.4 
 
 
922 aa  471  1e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.97 
 
 
887 aa  468  1e-130  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  40.47 
 
 
626 aa  467  1e-130  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 
661 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  35.95 
 
 
872 aa  464  1e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 
640 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  41.22 
 
 
663 aa  466  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  41.43 
 
 
621 aa  462  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  39 
 
 
642 aa  461  1e-128  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 
874 aa  459  1e-128  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  39.35 
 
 
645 aa  459  1e-128  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  39.87 
 
 
653 aa  461  1e-128  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 
860 aa  459  1e-128  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.92 
 
 
894 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  35.47 
 
 
882 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  41.05 
 
 
679 aa  454  1e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 
645 aa  456  1e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
663 aa  454  1e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  40.47 
 
 
600 aa  454  1e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  41.31 
 
 
677 aa  453  1e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  35.29 
 
 
879 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  35.28 
 
 
857 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  39.57 
 
 
626 aa  452  1e-125  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71239e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  35.28 
 
 
856 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  35.03 
 
 
910 aa  448  1e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 
681 aa  446  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  34.63 
 
 
898 aa  429  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  38.39 
 
 
591 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  39.23 
 
 
600 aa  407  1e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
803 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 
593 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 
566 aa  290  5e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.06678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  33.39 
 
 
589 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 
557 aa  282  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 
589 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  33.22 
 
 
589 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  34.07 
 
 
557 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  33.71 
 
 
613 aa  276  1e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  34.18 
 
 
557 aa  273  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  33.45 
 
 
573 aa  272  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 
563 aa  271  3e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
563 aa  271  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
544 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  4.315e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  31.81 
 
 
559 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.64247e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 
544 aa  263  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 
551 aa  250  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  31.25 
 
 
540 aa  236  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  29.5 
 
 
544 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 
543 aa  226  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 
545 aa  223  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.66 
 
 
546 aa  221  4e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 
537 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  29.15 
 
 
537 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>