More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0092 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0092  iojap-like protein  100 
 
 
114 aa  233  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3646  iojap-like protein  55.21 
 
 
150 aa  125  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.75973e-07  normal  0.475596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2516  iojap-like protein  44.74 
 
 
118 aa  115  2e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  2.07265e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0237  iojap-like protein  53.68 
 
 
198 aa  113  7e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0226  iojap-like protein  53.68 
 
 
198 aa  113  7e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0213  Iojap-related protein  53.68 
 
 
107 aa  112  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277011  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0228  iojap-like protein  52.63 
 
 
191 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.689651  normal  0.307872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1866  iojap-like protein  44.04 
 
 
118 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.2805e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3209  iojap-related protein  46.32 
 
 
131 aa  100  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.013969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3454  iojap-like protein  43.88 
 
 
150 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2934  iojap-like protein  47.52 
 
 
128 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.968442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01219  hypothetical protein  43.69 
 
 
105 aa  99  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3013  iojap-like protein  44.21 
 
 
166 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357309  normal  0.915296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1774  iojap-related protein  41.67 
 
 
156 aa  99  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3201  Iojap-related protein  50.53 
 
 
131 aa  99.4  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.12867e-19  unclonable  7.41028e-24 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4206  iojap-like protein  44.44 
 
 
149 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.573117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3882  iojap-like protein  44.44 
 
 
147 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.604343  normal  0.0302517 
 
 
-
 
NC_004310  BR1841  iojap-related protein  41.67 
 
 
117 aa  98.6  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1058  iojap-like protein  41.67 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12030  hypothetical protein  39.81 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00879098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1104  hypothetical protein  42.27 
 
 
118 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4129  iojap-like protein  48.42 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.89424e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004220  hypothetical protein  41.75 
 
 
105 aa  97.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00071389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2577  Iojap-related protein  46.88 
 
 
119 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.56032e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2664  iojap-like protein  46.67 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000901507  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4278  hypothetical protein  43.43 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0910  Iojap family protein  40 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4721  iojap-like protein  43.16 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0866912  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2250  iojap-like protein  46.81 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1476  iojap-like protein  46.32 
 
 
168 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.332262  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3613  iojap-like protein  48.42 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  2.08423e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3776  iojap-like protein  45.26 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.07395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0192  iojap-like protein  45.36 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.39024e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2060  iojap-like protein  46.15 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2793  iojap-like protein  44.21 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3860  iojap-like protein  45.26 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13380  iojap-like protein  46.67 
 
 
121 aa  94.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.129259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0432  iojap-like protein  43.16 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18190  iojap-related protein  50.53 
 
 
125 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0163  Iojap-related protein  43.62 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2110  iojap-like protein  41.12 
 
 
117 aa  94.4  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0569  Iojap-related protein  45.74 
 
 
210 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0097  Iojap-related protein  44.21 
 
 
131 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0187008  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4367  Iojap-related protein  42.59 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4827  iojap-related protein  42.45 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.943671  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1641  iojap-like protein  45 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660201 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12550  iojap-related protein  48.91 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.679587  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1783  iojap-like protein  45.63 
 
 
144 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3800  iojap-like protein  37.37 
 
 
122 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825219  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0522  Iojap-related protein  38.18 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0513689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01659  iojap domain protein  45.65 
 
 
105 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  5.04193e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2137  iojap-like protein  50.57 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.49501e-13 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1821  iojap-like protein  43.24 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.383706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2383  iojap-like protein  51.14 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00906189  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2274  iojap-like protein  44.79 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  2.01224e-05  hitchhiker  0.000438261 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1581  hypothetical protein  39.62 
 
 
117 aa  92.4  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  5.88564e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0701  iojap-like protein  36.89 
 
 
109 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.19797e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0648  iojap-like protein  42.16 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1253  iojap-like protein  41.41 
 
 
110 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00407148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3307  iojap-like protein  43.88 
 
 
115 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.23789e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0255  Iojap-related protein  43.62 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1555  iojap-like protein  50.56 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1094  hypothetical protein  43.48 
 
 
105 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0161  iojap-like protein  43.62 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0417  hypothetical protein  42.55 
 
 
148 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2660  Iojap-related protein  38.83 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00250929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0686  iojap-like protein  41.58 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.89548e-09  normal  0.0203597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0022  Iojap-related protein  38.61 
 
 
163 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1094  iojap-like protein  43.16 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.43508e-10  hitchhiker  4.78913e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3273  iojap-like protein  43.16 
 
 
109 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.12761e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0101  iojap-like protein  41.49 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0087  iojap-like protein  44.68 
 
 
110 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00113012  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3315  iojap-like protein  43.16 
 
 
114 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.32969e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3451  iojap-like protein  43.16 
 
 
114 aa  91.3  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.16802e-08  hitchhiker  0.00269335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3343  Poly(A) polymerase, PcnB  36.84 
 
 
114 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  5.74363e-11  normal  0.0167921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2013  iojap-like protein  42.57 
 
 
117 aa  90.5  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1238  iojap-like protein  33.96 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0475  hypothetical protein  43.82 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0369848  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0744  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.5  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000588326  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1183  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2170  Iojap-related protein  47.37 
 
 
134 aa  90.5  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186283  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0857  Iojap-related protein  39.81 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.12346e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0657  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.77395e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11480  iojap-related protein  44.57 
 
 
148 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  hitchhiker  0.00298358 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3008  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.22967e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0689  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.12038e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00595  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.76829e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0663  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.19857e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3631  iojap-like protein  40 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  9.86152e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0567  Iojap-related protein  45.26 
 
 
115 aa  90.1  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00606  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  6.79952e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0614  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.11441e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0095  iojap-like protein  43.33 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  2.7247e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0698  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  1.07419e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0758  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000297026  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0726  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.27237e-08  normal  0.102561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2989  iojap-like protein  41.3 
 
 
105 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.79848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0684  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.84258e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0802  hypothetical protein  41.3 
 
 
105 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  2.95107e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0405  iojap-like protein  40.86 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64212  normal  0.310869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>