More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0090 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
418 aa  849  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.83 
 
 
418 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.46583e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.11 
 
 
418 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.48 
 
 
416 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.11 
 
 
418 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.96 
 
 
418 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.41705e-05  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.29 
 
 
418 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.76636e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.95 
 
 
418 aa  518  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.43 
 
 
418 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.57014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.71 
 
 
418 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.22 
 
 
418 aa  488  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.5 
 
 
418 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.66 
 
 
418 aa  484  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  60.71 
 
 
427 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.21 
 
 
419 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.25 
 
 
434 aa  465  1e-130  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.05 
 
 
419 aa  468  1e-130  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.05 
 
 
419 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.27 
 
 
414 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 
421 aa  462  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.1 
 
 
456 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.96 
 
 
426 aa  458  1e-128  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 
446 aa  460  1e-128  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.35756e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.09 
 
 
419 aa  460  1e-128  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.72 
 
 
426 aa  458  1e-128  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.05 
 
 
420 aa  459  1e-128  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.54 
 
 
417 aa  455  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.81 
 
 
423 aa  454  1e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.83 
 
 
430 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  54.94 
 
 
423 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.2 
 
 
419 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.68 
 
 
418 aa  446  1e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.78 
 
 
417 aa  445  1e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.72 
 
 
418 aa  448  1e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.21 
 
 
426 aa  446  1e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.89 
 
 
436 aa  447  1e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.07 
 
 
429 aa  444  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.66 
 
 
426 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.84 
 
 
419 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
423 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.55 
 
 
423 aa  438  1e-122  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2142  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
424 aa  438  1e-122  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.89 
 
 
435 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4811  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.68 
 
 
423 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.41418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.9 
 
 
426 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  55.66 
 
 
428 aa  437  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4369  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.41 
 
 
421 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.87 
 
 
414 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.68 
 
 
421 aa  438  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.07 
 
 
425 aa  435  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
415 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
415 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 
418 aa  431  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.88 
 
 
419 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
423 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0610  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.17 
 
 
423 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4864  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 
423 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.797783  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4686  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.68 
 
 
423 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.820899  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
423 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.34 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.34 
 
 
415 aa  431  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.83 
 
 
435 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
415 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.36 
 
 
423 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  8.81796e-12 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.34 
 
 
415 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4829  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 
421 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.89 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.36 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.25 
 
 
448 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
416 aa  428  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.43 
 
 
429 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
423 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
423 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
415 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.26 
 
 
435 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.34228e-06  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
415 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4425  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.85 
 
 
415 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.3 
 
 
425 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.07 
 
 
423 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  1.20564e-09 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.09 
 
 
415 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.33 
 
 
416 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.48 
 
 
423 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
420 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
415 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.98 
 
 
421 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 
415 aa  421  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.35 
 
 
425 aa  415  1e-115  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.5 
 
 
411 aa  415  1e-115  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
415 aa  417  1e-115  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
413 aa  416  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0321  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.88 
 
 
435 aa  416  1e-115  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.155357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.71 
 
 
421 aa  417  1e-115  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.25 
 
 
419 aa  416  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2852  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.24 
 
 
419 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204057  hitchhiker  1.32471e-07 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>