More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0089 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  100 
 
 
376 aa  771  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 
373 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.19132e-06  unclonable  1.82515e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  49.86 
 
 
372 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3643  glutamate 5-kinase  50.4 
 
 
392 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  48.92 
 
 
373 aa  364  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.04023e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  48.39 
 
 
373 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 
390 aa  340  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.35095e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3420  gamma-glutamyl kinase  46.24 
 
 
384 aa  339  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  47.21 
 
 
378 aa  337  2e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  45.75 
 
 
375 aa  337  2e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  46.36 
 
 
373 aa  332  5e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  47.98 
 
 
387 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  47.04 
 
 
376 aa  330  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  48.75 
 
 
383 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
368 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  45.68 
 
 
376 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  47.96 
 
 
374 aa  322  5e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  47.58 
 
 
373 aa  322  8e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  46.81 
 
 
377 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  47.06 
 
 
373 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2179  gamma-glutamyl kinase  44.56 
 
 
378 aa  317  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  47.28 
 
 
372 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  47.53 
 
 
372 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  45.82 
 
 
373 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.15273e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  46.7 
 
 
390 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  47.06 
 
 
373 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  6.15506e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  47.95 
 
 
372 aa  313  3e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3036  gamma-glutamyl kinase  45.7 
 
 
375 aa  312  7e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.684546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  47.67 
 
 
372 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
374 aa  310  3e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  44.2 
 
 
376 aa  308  8e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  1.1704e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
376 aa  308  1e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  46.45 
 
 
375 aa  306  5e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1377  gamma-glutamyl kinase  43.94 
 
 
395 aa  305  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  44.54 
 
 
373 aa  303  2e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  46.13 
 
 
372 aa  304  2e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4857  gamma-glutamyl kinase  47.67 
 
 
373 aa  303  4e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
373 aa  303  4e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
367 aa  302  6e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2055  gamma-glutamyl kinase  43.97 
 
 
380 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.427749  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2689  gamma-glutamyl kinase  43.28 
 
 
379 aa  300  3e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  43.8 
 
 
393 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1538  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 
393 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0800  glutamate 5-kinase  47.12 
 
 
372 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  45.3 
 
 
374 aa  299  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  44.26 
 
 
373 aa  298  9e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3679  gamma-glutamyl kinase  47.12 
 
 
372 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  43.72 
 
 
379 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  45.73 
 
 
371 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  43.72 
 
 
383 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0704  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
372 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5483  gamma-glutamyl kinase  44.89 
 
 
382 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.494912  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  43.72 
 
 
383 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  41.02 
 
 
373 aa  295  7e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  43.53 
 
 
371 aa  295  7e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0748  gamma-glutamyl kinase  46.7 
 
 
378 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00331357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4235  glutamate 5-kinase  44.77 
 
 
374 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0018529  hitchhiker  1.38199e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
374 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
379 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3446  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0629707  hitchhiker  0.00515301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  44.35 
 
 
372 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0477  gamma-glutamyl kinase  45.9 
 
 
378 aa  292  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.192225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0723  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
372 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0596131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0691  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
372 aa  291  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  44.63 
 
 
369 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4494  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
372 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.149701  normal  0.472988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0510  gamma-glutamyl kinase  46.28 
 
 
372 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596992  normal  0.92203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0723  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 
372 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0514  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
372 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0700607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 
370 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0836  gamma-glutamyl kinase  45.6 
 
 
378 aa  290  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.986604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2955  gamma-glutamyl kinase  45.36 
 
 
372 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  42.82 
 
 
367 aa  289  5e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1271  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
378 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100381  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  40.86 
 
 
373 aa  288  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0226  glutamate 5-kinase  43.67 
 
 
377 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.407521  normal  0.106381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1011  gamma-glutamyl kinase  43.82 
 
 
373 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00115076  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 
372 aa  285  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1707  glutamate 5-kinase  43.85 
 
 
388 aa  285  8e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0459  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
376 aa  285  1e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176119 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0281  glutamate 5-kinase  43.63 
 
 
376 aa  285  1e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  43.41 
 
 
370 aa  284  2e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0858  gamma-glutamyl kinase  47.54 
 
 
374 aa  284  2e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0105345  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2654  gamma-glutamyl kinase  44.74 
 
 
374 aa  284  2e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00506525  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  42.98 
 
 
372 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3103  gamma-glutamyl kinase  44.81 
 
 
372 aa  283  3e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0848  gamma-glutamyl kinase  45.48 
 
 
380 aa  283  4e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1143  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  283  4e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3274  gamma-glutamyl kinase  45.38 
 
 
372 aa  283  4e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  282  7e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  282  7e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  44.9 
 
 
372 aa  282  7e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2799  gamma-glutamyl kinase  45.45 
 
 
372 aa  282  7e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>