More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0088 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
333 aa  667  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.5 
 
 
426 aa  330  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  54.46 
 
 
366 aa  325  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  52.11 
 
 
350 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.54 
 
 
338 aa  315  7e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  51.34 
 
 
366 aa  314  1e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  52.71 
 
 
338 aa  313  2e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  53.27 
 
 
368 aa  312  6e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  51.62 
 
 
366 aa  312  6e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  52.25 
 
 
338 aa  310  3e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  53.87 
 
 
338 aa  309  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.07 
 
 
417 aa  308  6e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.35 
 
 
438 aa  307  2e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.77499e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  52.96 
 
 
424 aa  305  1e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  54.19 
 
 
348 aa  304  1e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.37 
 
 
387 aa  304  1e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  50.61 
 
 
327 aa  302  4e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.7 
 
 
337 aa  302  4e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.04 
 
 
429 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  51.98 
 
 
427 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  52.63 
 
 
338 aa  300  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.76 
 
 
423 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.32 
 
 
338 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.55 
 
 
370 aa  297  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  51.76 
 
 
347 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.2 
 
 
338 aa  295  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
425 aa  295  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  51.37 
 
 
428 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  51.37 
 
 
428 aa  294  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  52.92 
 
 
395 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.55 
 
 
350 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  56.25 
 
 
358 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.65 
 
 
341 aa  293  4e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  51.81 
 
 
345 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 
426 aa  292  7e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.65 
 
 
341 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  49.54 
 
 
337 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  51.66 
 
 
338 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50.31 
 
 
435 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.66 
 
 
369 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50.31 
 
 
435 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  50.76 
 
 
432 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  49.1 
 
 
440 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  47.18 
 
 
439 aa  289  4e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.39 
 
 
426 aa  289  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  50.15 
 
 
353 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
336 aa  288  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.91 
 
 
435 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.47 
 
 
356 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.49 
 
 
397 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  49.25 
 
 
406 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  48.35 
 
 
406 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  48.82 
 
 
437 aa  286  3e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.35 
 
 
338 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.22 
 
 
454 aa  285  6e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  50.46 
 
 
428 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.65 
 
 
343 aa  285  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.59 
 
 
406 aa  284  1e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.03 
 
 
439 aa  283  2e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  50.61 
 
 
428 aa  283  2e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  50.46 
 
 
354 aa  283  2e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  49.4 
 
 
339 aa  283  2e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  48.64 
 
 
326 aa  283  2e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  1.4819e-05  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.23 
 
 
356 aa  283  3e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.8 
 
 
343 aa  283  3e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
434 aa  283  4e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  50.46 
 
 
354 aa  283  4e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 
425 aa  283  4e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.29 
 
 
346 aa  283  4e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.96 
 
 
340 aa  283  4e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  48.18 
 
 
346 aa  283  4e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  5.91605e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.2 
 
 
437 aa  282  4e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  49.4 
 
 
339 aa  283  4e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.2734e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.11 
 
 
374 aa  282  5e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.11 
 
 
374 aa  282  5e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  50.31 
 
 
427 aa  282  7e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.58 
 
 
422 aa  281  8e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  48.15 
 
 
336 aa  281  9e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  48.18 
 
 
394 aa  281  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  50.15 
 
 
354 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  50.31 
 
 
428 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  48.51 
 
 
435 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  53.64 
 
 
423 aa  280  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  48.66 
 
 
391 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  50.61 
 
 
428 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  48.95 
 
 
345 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  49.85 
 
 
352 aa  279  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  53.82 
 
 
439 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  50.61 
 
 
428 aa  279  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  45.78 
 
 
408 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  45.78 
 
 
408 aa  279  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  48.77 
 
 
392 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.71752e-05  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  47.59 
 
 
407 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  45.78 
 
 
408 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.89 
 
 
329 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  47.45 
 
 
439 aa  278  1e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  50.61 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  50.61 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.89 
 
 
329 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  50.31 
 
 
428 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>