More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0084 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0084  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
384 aa  794  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.2368e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.71 
 
 
370 aa  441  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  58.89 
 
 
373 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.13 
 
 
372 aa  439  1e-122  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.83 
 
 
372 aa  436  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.74 
 
 
386 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.4 
 
 
373 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.48 
 
 
377 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.43 
 
 
370 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.78979e-06  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.8 
 
 
371 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.59 
 
 
371 aa  416  1e-115  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.86 
 
 
375 aa  416  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.23 
 
 
373 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.06 
 
 
370 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.96 
 
 
375 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
374 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.9 
 
 
374 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.37 
 
 
380 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  55.43 
 
 
374 aa  407  1e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.06 
 
 
355 aa  406  1e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.38291e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.86 
 
 
379 aa  407  1e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.35 
 
 
370 aa  402  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.77 
 
 
376 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.62 
 
 
370 aa  399  1e-110  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.19 
 
 
367 aa  399  1e-110  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
376 aa  399  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.23 
 
 
369 aa  399  1e-110  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.52 
 
 
372 aa  400  1e-110  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.19 
 
 
394 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.85 
 
 
371 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.77 
 
 
385 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
380 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.26 
 
 
387 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.12 
 
 
399 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.02 
 
 
376 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.13 
 
 
370 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  52.05 
 
 
371 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.85 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
374 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000246245  hitchhiker  1.18913e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1447  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
374 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.28041e-06  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.7 
 
 
373 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.56741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1615  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.6 
 
 
376 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.214462  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.31 
 
 
407 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1435  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
374 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.52098e-07  hitchhiker  0.000858372 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
380 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
379 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.85 
 
 
395 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
395 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
379 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2892  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
377 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.103545  hitchhiker  0.000645764 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.1 
 
 
379 aa  391  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
383 aa  390  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  4.8864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
447 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1606  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.21 
 
 
388 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.894963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0144  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.51 
 
 
384 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0518824  decreased coverage  0.000581764 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.70513e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  3.10592e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3054  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.62 
 
 
379 aa  391  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0377683  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1215  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.7 
 
 
385 aa  389  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.557932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2702  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.09 
 
 
374 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  6.54614e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.48017e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.48 
 
 
390 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.75969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.49 
 
 
390 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.55 
 
 
379 aa  389  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3113  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.51523e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1470  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
377 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.97 
 
 
390 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.56565e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.11 
 
 
369 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
379 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.28432e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4345  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.92 
 
 
377 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.30572e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1406  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
374 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.937214  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.67 
 
 
383 aa  391  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.04 
 
 
367 aa  388  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.23 
 
 
390 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
397 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.1 
 
 
399 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
394 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
374 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.74895e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2193  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0616046  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2807  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.11087e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
397 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.59 
 
 
395 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
397 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  2.27158e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1570  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.09087e-05  hitchhiker  1.08069e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
379 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  5.78318e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
397 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2882  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.63226e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1927  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.14 
 
 
383 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000713351  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.09 
 
 
367 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2787  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.53 
 
 
374 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.35544e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2647  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.21 
 
 
381 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  9.56702e-08  hitchhiker  0.00180241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.36 
 
 
383 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 
397 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.78 
 
 
382 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>