214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0078 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 
331 aa  667  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1173  LAO/AO transport system ATPase  55.03 
 
 
329 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  57.01 
 
 
330 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  58.88 
 
 
330 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  55.76 
 
 
333 aa  354  9e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  58.75 
 
 
329 aa  353  3e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2293  arginine/ornithine transport system ATPase  52.34 
 
 
366 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000757851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1350  arginine/ornithine transport system ATPase  54.27 
 
 
372 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0354539  unclonable  2.82575e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3485  arginine/ornithine transport system ATPase  55.66 
 
 
347 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  61 
 
 
328 aa  346  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  57.19 
 
 
328 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1754  arginine/ornithine transport system ATPase  58.22 
 
 
331 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0280  arginine/ornithine transport system ATPase  52.96 
 
 
382 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  55.56 
 
 
378 aa  343  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5021  LAO/AO transport system ATPase  51.88 
 
 
363 aa  341  9e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0197522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  55.59 
 
 
333 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  56.77 
 
 
330 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  56.96 
 
 
329 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  56.96 
 
 
346 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  58.17 
 
 
345 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  55.49 
 
 
332 aa  337  1e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  54.92 
 
 
380 aa  336  3e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  53.42 
 
 
332 aa  335  8e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2640  arginine/ornithine transport system ATPase  57.77 
 
 
326 aa  334  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  59.51 
 
 
329 aa  333  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  55.59 
 
 
346 aa  332  7e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09151  arginine/ornithine transport system ATPase  51.46 
 
 
359 aa  327  1e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.471004  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  59.11 
 
 
326 aa  327  1e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  55.45 
 
 
329 aa  325  8e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  53.54 
 
 
364 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4005  arginine/ornithine transport system ATPase  53.27 
 
 
329 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2240  arginine/ornithine transport system ATPase  54.61 
 
 
326 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  53.92 
 
 
372 aa  323  3e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0387  LAO/AO transport system ATPase  53.02 
 
 
332 aa  319  4e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3946  LAO/AO transport system ATPase  51.41 
 
 
337 aa  318  6e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  53.11 
 
 
325 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  53.11 
 
 
325 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  53.11 
 
 
325 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  53.31 
 
 
329 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3259  LAO/AO transport system ATPase  54.46 
 
 
322 aa  316  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00849768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1850  arginine/ornithine transport system ATPase  51.52 
 
 
342 aa  314  1e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
374 aa  313  3e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  52.85 
 
 
332 aa  312  4e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  51.57 
 
 
331 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  53.33 
 
 
322 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2020  LAO/AO transport system ATPase  47.22 
 
 
339 aa  309  4e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1283  arginine/ornithine transport system ATPase  51.43 
 
 
381 aa  308  6e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3754  arginine/ornithine transport system ATPase  51.06 
 
 
373 aa  308  7e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.402613  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1919  LAO/AO transport system ATPase  54.69 
 
 
327 aa  308  7e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.250647  normal  0.437335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6417  LAO/AO transport system ATPase  52.5 
 
 
328 aa  307  1e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1015  arginine/ornithine transport system ATPase  50.9 
 
 
337 aa  307  2e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0321  arginine/ornithine transport system ATPase  47.62 
 
 
343 aa  306  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.659399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2163  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 
345 aa  306  4e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.191923  normal  0.423822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2804  arginine/ornithine transport system ATPase  50.95 
 
 
352 aa  305  1e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0929254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22160  LAO/AO transport system ATPase  49.23 
 
 
330 aa  303  2e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.436585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11526  arginine/ornithine transport system ATPase  52.79 
 
 
334 aa  303  2e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139624 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2382  arginine/ornithine transport system ATPase  48.93 
 
 
334 aa  303  2e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1322  arginine/ornithine transport system ATPase  56.83 
 
 
351 aa  303  3e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.822906  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2041  arginine/ornithine transport system ATPase  51.94 
 
 
321 aa  303  3e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.749207  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
343 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3400  arginine/ornithine transport system ATPase  47.89 
 
 
343 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2106  LAO/AO transport system ATPase  50.16 
 
 
330 aa  295  6e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2129  arginine/ornithine transport system ATPase  49.36 
 
 
350 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2695  arginine/ornithine transport system ATPase  50.78 
 
 
351 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1166  arginine/ornithine transport system ATPase  45.43 
 
 
337 aa  293  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00541841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0911  arginine/ornithine transport system ATPase  47.62 
 
 
341 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2512  arginine/ornithine transport system ATPase  48.66 
 
 
340 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.210765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0867  arginine/ornithine transport system ATPase  46.42 
 
 
334 aa  290  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3076  arginine/ornithine transport system ATPase  45.69 
 
 
331 aa  282  4e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02712  hypothetical protein  45.69 
 
 
331 aa  282  4e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0775  LAO/AO transport system ATPase  45.69 
 
 
331 aa  282  4e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02749  arginine/ornithine transport system ATPase  45.69 
 
 
331 aa  282  4e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3245  arginine/ornithine transport system ATPase  45.69 
 
 
331 aa  281  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0792  arginine/ornithine transport system ATPase  45.69 
 
 
331 aa  281  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4214  arginine/ornithine transport system ATPase  45.37 
 
 
331 aa  280  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3054  arginine/ornithine transport system ATPase  49.3 
 
 
331 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1356  LAO/AO transport system ATPase  47.9 
 
 
345 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229963  normal  0.961808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3340  arginine/ornithine transport system ATPase  45.05 
 
 
331 aa  278  9e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  49.38 
 
 
328 aa  276  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1237  arginine/ornithine transport system ATPase  44.44 
 
 
336 aa  273  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0931  arginine/ornithine transport system ATPase  50 
 
 
341 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1163  arginine/ornithine transport system ATPase  44.69 
 
 
343 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0511506  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0874  LAO/AO transport system ATPase  42.54 
 
 
341 aa  265  6e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0562176  normal  0.0447783 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1172  LAO/AO transport system ATPase  41.96 
 
 
335 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.978419  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2431  arginine/ornithine transport system ATPase  47.5 
 
 
337 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698067  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3113  arginine/ornithine transport system ATPase  49.68 
 
 
323 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.455526  hitchhiker  0.00331919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2015  arginine/ornithine transport system ATPase  50.16 
 
 
323 aa  254  2e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.805467  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1293  arginine/ornithine transport system ATPase  44.51 
 
 
337 aa  254  2e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0725  arginine/ornithine transport system ATPase  50.16 
 
 
323 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254962  normal  0.371915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0670  arginine/ornithine transport system ATPase  49.01 
 
 
333 aa  252  6e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.160836  normal  0.268873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2582  arginine/ornithine transport system ATPase  45.81 
 
 
358 aa  249  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.575877  hitchhiker  0.000151333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3457  arginine/ornithine transport system ATPase  45.36 
 
 
303 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12878  predicted protein  39.38 
 
 
312 aa  209  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0496106  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  40.13 
 
 
312 aa  205  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  42.86 
 
 
318 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  40.14 
 
 
316 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  38.46 
 
 
309 aa  180  3e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  35.13 
 
 
312 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  38.14 
 
 
356 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  37.34 
 
 
308 aa  174  3e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.072512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>