More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0077 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  59.45 
 
 
522 aa  643  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  62.16 
 
 
512 aa  660  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  59.84 
 
 
516 aa  634  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  100 
 
 
517 aa  1075  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  57.67 
 
 
528 aa  639  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  58.8 
 
 
516 aa  641  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  59.53 
 
 
519 aa  645  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  61.23 
 
 
515 aa  669  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  63.3 
 
 
518 aa  694  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  61.33 
 
 
514 aa  676  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  59.06 
 
 
531 aa  648  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  60.35 
 
 
516 aa  668  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  61.51 
 
 
517 aa  668  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  57.67 
 
 
550 aa  637  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  61.4 
 
 
514 aa  681  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  62.7 
 
 
516 aa  688  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  62.52 
 
 
508 aa  681  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  69.05 
 
 
517 aa  768  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  58.56 
 
 
516 aa  637  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  64.85 
 
 
516 aa  722  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  5.27493e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  61.42 
 
 
515 aa  672  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  61.21 
 
 
512 aa  659  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  59.48 
 
 
519 aa  631  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  59.48 
 
 
519 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  58.45 
 
 
530 aa  629  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  59.27 
 
 
519 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  57.7 
 
 
514 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  58.09 
 
 
510 aa  627  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  58.06 
 
 
520 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  59.88 
 
 
513 aa  626  1e-178  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3166  carboxyl transferase  59.52 
 
 
521 aa  621  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0567033  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  57.89 
 
 
510 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  57.7 
 
 
510 aa  624  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  56.48 
 
 
517 aa  624  1e-177  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  57.03 
 
 
522 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  56.73 
 
 
510 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  56.34 
 
 
510 aa  620  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  55.43 
 
 
522 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  57.74 
 
 
537 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  57.7 
 
 
510 aa  620  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  60.24 
 
 
516 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  55.96 
 
 
520 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  56.23 
 
 
531 aa  620  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  55.75 
 
 
516 aa  618  1e-176  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  57.12 
 
 
510 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  55.36 
 
 
510 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  56.34 
 
 
510 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  56.09 
 
 
534 aa  616  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  57.33 
 
 
526 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  57.73 
 
 
513 aa  614  1e-174  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0358  carboxyl transferase  56.73 
 
 
510 aa  612  1e-174  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0326  carboxyl transferase  56.73 
 
 
510 aa  612  1e-174  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  0.0697048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  57.53 
 
 
510 aa  613  1e-174  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  56.48 
 
 
514 aa  612  1e-174  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  57.59 
 
 
510 aa  613  1e-174  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  56.92 
 
 
510 aa  614  1e-174  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  57.5 
 
 
510 aa  614  1e-174  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  56.19 
 
 
513 aa  611  1e-174  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  56.92 
 
 
529 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  56.67 
 
 
510 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  55.75 
 
 
510 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  55.43 
 
 
531 aa  608  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  57.7 
 
 
532 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  55.36 
 
 
510 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2835  carboxyl transferase  56.14 
 
 
510 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.497575  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0282  carboxyl transferase  56.53 
 
 
510 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  56.01 
 
 
551 aa  605  1e-172  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  54.91 
 
 
536 aa  604  1e-172  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  55.88 
 
 
519 aa  605  1e-172  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0553  carboxyl transferase  57.62 
 
 
518 aa  607  1e-172  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.965666  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  58.67 
 
 
516 aa  607  1e-172  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  55.22 
 
 
546 aa  605  1e-172  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  56.43 
 
 
527 aa  607  1e-172  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  6.59561e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25440  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  56.24 
 
 
532 aa  604  1e-172  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199435  normal  0.360386 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  55.9 
 
 
527 aa  605  1e-172  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  57.7 
 
 
520 aa  605  1e-172  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  55.3 
 
 
543 aa  602  1e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  56.08 
 
 
518 aa  603  1e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  55.95 
 
 
510 aa  604  1e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  56.09 
 
 
530 aa  603  1e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6139  carboxyl transferase  55.95 
 
 
510 aa  603  1e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.222288 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  55.17 
 
 
510 aa  602  1e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  55.06 
 
 
511 aa  601  1e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  55.13 
 
 
536 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5659  carboxyl transferase  55.1 
 
 
510 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4725  carboxyl transferase  55.17 
 
 
510 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.48705  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.9 
 
 
513 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0307  carboxyl transferase  57.23 
 
 
516 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0156  carboxyl transferase  56.03 
 
 
513 aa  600  1e-170  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.344953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  54.93 
 
 
524 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  55.86 
 
 
510 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  54.4 
 
 
523 aa  595  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  54.9 
 
 
510 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  56.45 
 
 
518 aa  596  1e-169  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2894  carboxyl transferase  56.36 
 
 
510 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.437903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  54.97 
 
 
510 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  55.04 
 
 
513 aa  597  1e-169  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  54.97 
 
 
510 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  56.34 
 
 
542 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  53.59 
 
 
524 aa  592  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>