122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0055 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0055  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  547  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.345745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3335  hypothetical protein  43.31 
 
 
274 aa  213  2e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1210  hypothetical protein  42.91 
 
 
274 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.749263  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1105  hypothetical protein  40.62 
 
 
274 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1281  hypothetical protein  42.52 
 
 
274 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1211  hypothetical protein  42.52 
 
 
274 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1249  hypothetical protein  40.78 
 
 
274 aa  206  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1355  protein of unknown function DUF980  39.92 
 
 
274 aa  204  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.841736  unclonable  2.08839e-12 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2672  hypothetical protein  40.32 
 
 
274 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000377919  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3008  hypothetical protein  39.92 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.127511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3166  hypothetical protein  39.92 
 
 
274 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.262871  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1279  hypothetical protein  42.17 
 
 
274 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.42485  normal  0.255806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3023  hypothetical protein  39.53 
 
 
274 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0902222  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3456  hypothetical protein  42.91 
 
 
272 aa  197  2e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3868  protein of unknown function DUF980  40 
 
 
274 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.425991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2917  hypothetical protein  40.47 
 
 
255 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1531  hypothetical protein  39.22 
 
 
279 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2687  hypothetical protein  36.9 
 
 
272 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.201448  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1418  hypothetical protein  42.58 
 
 
274 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.955428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0677  hypothetical protein  37.35 
 
 
272 aa  188  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.358469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2377  hypothetical protein  40.56 
 
 
274 aa  185  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.993381  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0602  hypothetical protein  40.76 
 
 
254 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1293  hypothetical protein  39.68 
 
 
274 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2829  hypothetical protein  41.5 
 
 
261 aa  173  3e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.816483  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0929  hypothetical protein  36.48 
 
 
284 aa  162  5e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1665  hypothetical protein  37.98 
 
 
262 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.754327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2172  hypothetical protein  35.29 
 
 
277 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2033  hypothetical protein  38.4 
 
 
259 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.370372  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2460  hypothetical protein  40.16 
 
 
264 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.803917  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1873  hypothetical protein  40.45 
 
 
271 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1447  protein of unknown function DUF980  34.4 
 
 
291 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1159  hypothetical protein  37.66 
 
 
247 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5133  hypothetical protein  39.11 
 
 
277 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.635971  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2366  putative inner membrane protein  37.09 
 
 
277 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00016651  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6247  hypothetical protein  39.11 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0945015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1832  hypothetical protein  39.11 
 
 
277 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00498161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1856  hypothetical protein  38.71 
 
 
277 aa  148  1e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.145853 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1441  hypothetical protein  39.32 
 
 
277 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.130559  hitchhiker  0.00999787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1821  protein of unknown function DUF980  36.73 
 
 
278 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.571233  normal  0.0506575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0948  hypothetical protein  37.04 
 
 
280 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1089  hypothetical protein  36.14 
 
 
251 aa  146  4e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.260787 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0591  hypothetical protein  37.93 
 
 
271 aa  146  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1372  hypothetical protein  37.73 
 
 
251 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1770  hypothetical protein  38.31 
 
 
276 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.693928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1743  hypothetical protein  38.4 
 
 
276 aa  145  7e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335992  normal  0.179509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0422  hypothetical protein  36.08 
 
 
264 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2898  hypothetical protein  36.78 
 
 
256 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.636756  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2870  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.850064  normal  0.535733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1027  protein of unknown function DUF980  35.64 
 
 
288 aa  140  2e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.131102  normal  0.196659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3828  hypothetical protein  37.11 
 
 
275 aa  140  2e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1395  hypothetical protein  37.61 
 
 
258 aa  140  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2213  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  139  4e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.4309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2251  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  139  4e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.147808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0584  hypothetical protein  36.78 
 
 
271 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.640685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2379  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1858  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0039  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153122  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1368  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1129  hypothetical protein  37.1 
 
 
281 aa  138  9e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2214  hypothetical protein  36.69 
 
 
281 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.416427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0865  hypothetical protein  36.72 
 
 
269 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0769  hypothetical protein  34.11 
 
 
257 aa  134  2e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107825  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0723  hypothetical protein  34.51 
 
 
269 aa  134  2e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0625  hypothetical protein  34.87 
 
 
269 aa  133  4e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.461583 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0539  hypothetical protein  35.25 
 
 
271 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0578  hypothetical protein  35.25 
 
 
271 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244001  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1119  protein of unknown function DUF980  38.14 
 
 
288 aa  132  8e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598803  normal  0.193609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4995  hypothetical protein  35.34 
 
 
270 aa  131  1e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3127  hypothetical protein  34.56 
 
 
256 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.363658  normal  0.161606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2196  protein of unknown function DUF980  35.05 
 
 
270 aa  129  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000615921  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3095  protein of unknown function DUF980  33.96 
 
 
263 aa  128  1e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.607966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2209  protein of unknown function DUF980  35.62 
 
 
257 aa  127  2e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.183224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1184  hypothetical protein  34.89 
 
 
288 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0742773  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2136  hypothetical protein  34.94 
 
 
296 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140487  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0695  hypothetical protein  34.58 
 
 
253 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11700  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2119  hypothetical protein  34.56 
 
 
285 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1075  hypothetical protein  35.59 
 
 
276 aa  122  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2502  hypothetical protein  38.02 
 
 
289 aa  122  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.779846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2096  protein of unknown function DUF980  37.87 
 
 
285 aa  121  1e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1618  hypothetical protein  37.87 
 
 
285 aa  120  2e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07950  hypothetical protein  33.96 
 
 
274 aa  118  8e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2231  protein of unknown function DUF980  36.59 
 
 
304 aa  115  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.335785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0178  protein of unknown function DUF980  29.66 
 
 
260 aa  114  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.81555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2314  hypothetical protein  34.06 
 
 
291 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.600189  hitchhiker  0.00085516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0013  hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1548  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  31.82 
 
 
274 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.802606  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4583  protein of unknown function DUF980  27.38 
 
 
261 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24438  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0532  hypothetical protein  26.98 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2335  protein of unknown function DUF980  31.82 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2711  hypothetical protein  35.05 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2392  hypothetical protein  28.39 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.26056e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2490  hypothetical protein  28.39 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02840  hypothetical protein  29.58 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3110  hypothetical protein  32.44 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.741198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2066  hypothetical protein  31.72 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  6.83564e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2162  hypothetical protein  31.47 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000383294  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3371  protein of unknown function DUF980  27.41 
 
 
267 aa  92  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.279685 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2219  hypothetical protein  31.72 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  0.573011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2166  hypothetical protein  31.72 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000309216  normal  0.207813 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>