100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0048 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0048  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  834  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2235  VWA containing CoxE family protein  55.5 
 
 
396 aa  493  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0438  hypothetical protein  53.12 
 
 
396 aa  454  1e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4469  hypothetical protein  36.74 
 
 
395 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2882  hypothetical protein  37.77 
 
 
395 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1659  hypothetical protein  37.65 
 
 
395 aa  269  6e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2133  hypothetical protein  38.66 
 
 
402 aa  268  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000802256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3559  hypothetical protein  37.29 
 
 
395 aa  267  3e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.306765  normal  0.452046 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0107  hypothetical protein  36.7 
 
 
390 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.183182  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0858  hypothetical protein  35.83 
 
 
407 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0927  hypothetical protein  37.32 
 
 
391 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.045473  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1591  hypothetical protein  34.83 
 
 
403 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.66492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0862  hypothetical protein  37.07 
 
 
391 aa  258  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0358737  normal  0.649536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1219  hypothetical protein  35.38 
 
 
405 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0810  hypothetical protein  37.94 
 
 
407 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.487209  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2871  hypothetical protein  37.59 
 
 
391 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0850  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.207331  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1937  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0236151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1169  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1177  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0298  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1015  hypothetical protein  39.66 
 
 
391 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5019  VWA containing CoxE family protein  38.63 
 
 
400 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.232102  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1330  hypothetical protein  39.66 
 
 
798 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0803  hypothetical protein  37.47 
 
 
407 aa  255  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2252  hypothetical protein  38.29 
 
 
391 aa  254  1e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523205  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0905  hypothetical protein  37.14 
 
 
391 aa  255  1e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.687363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0996  hypothetical protein  36.17 
 
 
391 aa  254  2e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.397652  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1091  hypothetical protein  37.23 
 
 
393 aa  254  2e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.613907  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1983  hypothetical protein  35.34 
 
 
391 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2124  hypothetical protein  38.74 
 
 
391 aa  253  4e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.466092  normal  0.0154138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2372  hypothetical protein  37.8 
 
 
391 aa  252  9e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5675  hypothetical protein  38.05 
 
 
391 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1579  hypothetical protein  36.41 
 
 
392 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3316  hypothetical protein  37.77 
 
 
391 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3160  hypothetical protein  36.03 
 
 
393 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3459  hypothetical protein  38.16 
 
 
411 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0190687  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2356  VWA containing CoxE family protein  37.62 
 
 
391 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0964  hypothetical protein  39.17 
 
 
391 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0815038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2359  hypothetical protein  36.93 
 
 
395 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.588957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1721  VWA containing CoxE-like  37.8 
 
 
391 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0167307  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2333  VWA containing CoxE family protein  37.8 
 
 
391 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0944  VWA containing CoxE family protein  37.99 
 
 
391 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.248331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1787  hypothetical protein  35.92 
 
 
392 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739182  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1913  hypothetical protein  37.68 
 
 
391 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0562302  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1718  hypothetical protein  36.57 
 
 
414 aa  248  9e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0616459  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4574  hypothetical protein  35.02 
 
 
392 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0368264  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1315  hypothetical protein  35.02 
 
 
392 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.253274  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3954  hypothetical protein  36.21 
 
 
395 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1409  hypothetical protein  35.37 
 
 
392 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29160  hypothetical protein  35.68 
 
 
393 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0682429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4095  hypothetical protein  34.78 
 
 
392 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0303832  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1021  hypothetical protein  36.03 
 
 
391 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2102  hypothetical protein  37.26 
 
 
391 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4135  hypothetical protein  37.23 
 
 
391 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3906  hypothetical protein  35.27 
 
 
392 aa  246  5e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3297  hypothetical protein  35.35 
 
 
390 aa  246  7e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.88869  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3321  hypothetical protein  36.08 
 
 
392 aa  246  7e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3982  hypothetical protein  35.37 
 
 
393 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1614  hypothetical protein  35.64 
 
 
400 aa  245  1e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1230  VWA containing CoxE family protein  37.05 
 
 
391 aa  244  1e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.853007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6258  hypothetical protein  36.08 
 
 
391 aa  244  2e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0984  hypothetical protein  35.78 
 
 
391 aa  244  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0891  hypothetical protein  36.65 
 
 
394 aa  243  4e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0553053  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3874  hypothetical protein  34.78 
 
 
392 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0400507  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1408  hypothetical protein  34.78 
 
 
392 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32870  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  242  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1604  hypothetical protein  34.79 
 
 
392 aa  242  8e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1383  VWA containing CoxE family protein  35.99 
 
 
392 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521939  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1879  hypothetical protein  36.32 
 
 
395 aa  239  7e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.453094  normal  0.342483 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02166  hypothetical protein  34.87 
 
 
393 aa  236  5e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3607  hypothetical protein  36.34 
 
 
396 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2515  hypothetical protein  34.06 
 
 
392 aa  236  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.762903  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2685  hypothetical protein  36.08 
 
 
394 aa  234  2e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1642  hypothetical protein  35.04 
 
 
392 aa  233  4e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2057  hypothetical protein  34.71 
 
 
390 aa  233  4e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0516  hypothetical protein  37.68 
 
 
391 aa  232  8e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2536  hypothetical protein  35.85 
 
 
393 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129382  normal  0.412759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3782  VWA containing CoxE family protein  35.61 
 
 
390 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858588  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6601  hypothetical protein  38.44 
 
 
391 aa  227  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458102  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1511  hypothetical protein  35.02 
 
 
391 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1187  hypothetical protein  36.39 
 
 
394 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4250  hypothetical protein  34.88 
 
 
395 aa  223  5e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4979  hypothetical protein  35.01 
 
 
391 aa  222  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.042222 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2093  hypothetical protein  33.57 
 
 
393 aa  220  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0341328  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3988  VWA containing CoxE family protein  36.52 
 
 
393 aa  219  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1307  hypothetical protein  35.51 
 
 
394 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4929  hypothetical protein  35.75 
 
 
391 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2650  hypothetical protein  35.27 
 
 
394 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4465  hypothetical protein  34.53 
 
 
391 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.795551  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6064  hypothetical protein  35.84 
 
 
391 aa  213  4e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.19586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1945  hypothetical protein  34.38 
 
 
391 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0540863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2766  hypothetical protein  23.67 
 
 
411 aa  81.6  2e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114767  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3718  hypothetical protein  25.91 
 
 
354 aa  74.7  3e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.625161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2506  VWA containing CoxE family protein  23.39 
 
 
390 aa  71.6  2e-11  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1429  hypothetical protein  24.58 
 
 
386 aa  58.2  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1634  VWA containing CoxE-like  32 
 
 
400 aa  49.7  9e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4323  VWA containing CoxE family protein  34.67 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1785  VWA containing CoxE-like  34.33 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23574  normal  0.248193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0655  VWA containing CoxE family protein  23.77 
 
 
462 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>