More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0039 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  100 
 
 
245 aa  505  1e-142  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  56.22 
 
 
252 aa  274  1e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  37.78 
 
 
345 aa  165  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  39.64 
 
 
334 aa  159  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.62 
 
 
187 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  9.63559e-06 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.84 
 
 
202 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  25.91 
 
 
188 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.21 
 
 
194 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  30.88 
 
 
184 aa  86.3  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  28.91 
 
 
191 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.28 
 
 
189 aa  84.3  2e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  28.05 
 
 
189 aa  81.3  1e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28.72 
 
 
189 aa  81.3  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.74 
 
 
189 aa  80.1  3e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.62 
 
 
272 aa  80.1  3e-14  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  27.36 
 
 
188 aa  79.7  4e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.32 
 
 
188 aa  79.3  6e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.53 
 
 
188 aa  77.8  1e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  26.87 
 
 
186 aa  76.3  4e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  30.85 
 
 
170 aa  75.9  5e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  9.78378e-10  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.01 
 
 
196 aa  75.9  6e-13  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.42 
 
 
287 aa  75.1  9e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.30699e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  29.52 
 
 
192 aa  74.7  1e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.95 
 
 
173 aa  73.6  3e-12  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.1 
 
 
183 aa  73.2  4e-12  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.27 
 
 
190 aa  72.4  6e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.14 
 
 
214 aa  71.6  1e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.14 
 
 
191 aa  71.6  1e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.21 
 
 
176 aa  70.9  2e-11  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.29 
 
 
169 aa  70.1  3e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  5.75294e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  27.45 
 
 
189 aa  69.3  5e-11  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  27.05 
 
 
273 aa  69.3  6e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  9.69197e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  30.36 
 
 
204 aa  68.9  7e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  24.74 
 
 
185 aa  68.6  8e-11  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
272 aa  68.2  1e-10  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  5.9926e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.98 
 
 
170 aa  68.2  1e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  31.55 
 
 
223 aa  68.2  1e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.78 
 
 
167 aa  67.8  2e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  25.82 
 
 
274 aa  67.8  2e-10  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.98 
 
 
184 aa  67  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.44 
 
 
167 aa  66.6  3e-10  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  27.03 
 
 
275 aa  66.2  5e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  27.46 
 
 
177 aa  65.5  8e-10  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  48.33 
 
 
171 aa  65.5  9e-10  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  25.74 
 
 
163 aa  65.1  1e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.29 
 
 
196 aa  63.9  2e-09  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.12 
 
 
174 aa  63.9  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.89 
 
 
186 aa  63.9  2e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.2093e-14  hitchhiker  3.16815e-15 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  24.62 
 
 
169 aa  64.3  2e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  24.63 
 
 
169 aa  63.5  3e-09  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.22 
 
 
188 aa  63.5  3e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.22 
 
 
176 aa  63.2  3e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  27.87 
 
 
274 aa  63.5  3e-09  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  2.68728e-10  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.58 
 
 
215 aa  63.2  4e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  25.82 
 
 
166 aa  62.8  5e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  23.19 
 
 
171 aa  62.8  5e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  25.86 
 
 
215 aa  62.4  7e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56331e-14 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.76 
 
 
186 aa  62  8e-09  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  27.19 
 
 
272 aa  61.6  1e-08  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.94 
 
 
173 aa  61.2  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  25.94 
 
 
241 aa  61.2  1e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  25.91 
 
 
168 aa  61.6  1e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.49 
 
 
194 aa  61.6  1e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
178 aa  60.5  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  23.96 
 
 
212 aa  60.8  2e-08  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  27.37 
 
 
166 aa  60.5  2e-08  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  24.54 
 
 
185 aa  60.8  2e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  29.45 
 
 
191 aa  60.1  3e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.75 
 
 
275 aa  60.1  3e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.24 
 
 
183 aa  60.5  3e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  27.55 
 
 
224 aa  60.5  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.49 
 
 
194 aa  60.1  3e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  43.86 
 
 
174 aa  59.7  4e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.32 
 
 
163 aa  59.7  4e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  25.39 
 
 
274 aa  59.3  5e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24.68 
 
 
278 aa  58.9  7e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.00158e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  29.09 
 
 
181 aa  58.5  1e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  29.55 
 
 
172 aa  58.2  1e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  25.37 
 
 
274 aa  58.5  1e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.48 
 
 
215 aa  58.2  1e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  44.9 
 
 
166 aa  58.2  1e-07  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  27.27 
 
 
350 aa  58.2  1e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.8 
 
 
178 aa  58.2  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.48 
 
 
215 aa  58.2  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.48 
 
 
215 aa  58.2  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  24.04 
 
 
272 aa  58.5  1e-07  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  28.99 
 
 
273 aa  58.5  1e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  25.62 
 
 
169 aa  58.2  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.48 
 
 
215 aa  58.2  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  28.49 
 
 
228 aa  57.4  2e-07  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.67 
 
 
186 aa  57.4  2e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  23.26 
 
 
191 aa  57.4  2e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  26.51 
 
 
174 aa  56.6  3e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.86 
 
 
180 aa  57  3e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  7.44029e-11 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  27.01 
 
 
272 aa  57  3e-07  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  44.9 
 
 
166 aa  56.2  4e-07  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  28.43 
 
 
241 aa  56.2  4e-07  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.99 
 
 
178 aa  56.2  4e-07  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  26.67 
 
 
169 aa  56.2  4e-07  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  25.69 
 
 
215 aa  56.2  5e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>