123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0037 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0037  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
387 aa  796  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000760847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1264  S-layer domain protein  31.25 
 
 
402 aa  183  4e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.48204e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2376  S-layer domain protein  31.94 
 
 
403 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2179  hypothetical protein  31.4 
 
 
472 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000951574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
311 aa  58.9  1e-07  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.03 
 
 
820 aa  57  5e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
1276 aa  56.6  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
279 aa  55.8  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.53 
 
 
810 aa  55.8  1e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 
399 aa  55.1  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 
878 aa  55.1  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
405 aa  55.5  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0955  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.14 
 
 
220 aa  53.9  5e-06  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 
632 aa  53.1  7e-06  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  29.46 
 
 
585 aa  53.5  7e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
542 aa  52.4  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 
3145 aa  51.6  2e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
750 aa  50.8  4e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3363  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 
289 aa  50.8  4e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.040769  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
3301 aa  50.4  5e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 
295 aa  50.1  6e-05  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0905  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 
295 aa  50.1  7e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.06 
 
 
2240 aa  50.1  8e-05  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
649 aa  49.7  9e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
718 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
1421 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
566 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 
784 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 
576 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
715 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.42669e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  24.21 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  22.97 
 
 
573 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 
217 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.45 
 
 
1737 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 
554 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.47 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
748 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.96 
 
 
265 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  24.64 
 
 
887 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 
638 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
4079 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.53 
 
 
878 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 
227 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
789 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
265 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
615 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3665  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
289 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00516372  normal  0.53352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.82 
 
 
725 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  18.13 
 
 
979 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 
384 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 
955 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
927 aa  46.2  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  19.25 
 
 
3172 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
486 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
1276 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.67 
 
 
1764 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
187 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
522 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  30.08 
 
 
773 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
1112 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.18 
 
 
750 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.04 
 
 
875 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 
629 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.56 
 
 
1022 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1622  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 
247 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 
917 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  25.49 
 
 
566 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
1178 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1085 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
879 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 
827 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
828 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2356  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.337618  normal  0.0354802 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 
1056 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  23.63 
 
 
1331 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.97 
 
 
340 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 
626 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 
1154 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2954  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
1104 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 
818 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 
243 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  30.89 
 
 
729 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 
1694 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
1161 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  23.23 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
955 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.17 
 
 
349 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.72 
 
 
764 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0127  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
289 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  44.9 
 
 
531 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 
758 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 
522 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0054  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
227 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>