31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0036 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  594  1e-169  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.61635e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2180  hypothetical protein  26.06 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.577639  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2377  protein of unknown function DUF400  29.08 
 
 
306 aa  83.6  4e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  82.8  6e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0233  hypothetical protein  19.79 
 
 
278 aa  73.2  5e-12  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2148  OmpA family protein  22.56 
 
 
449 aa  72  1e-11  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2382  protein of unknown function DUF400  25.39 
 
 
316 aa  70.5  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.283039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  35.11 
 
 
178 aa  65.5  9e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  35.05 
 
 
161 aa  64.3  2e-09  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1673  hypothetical protein  23.33 
 
 
308 aa  63.9  3e-09  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  34.44 
 
 
209 aa  63.5  4e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  34 
 
 
223 aa  63.5  4e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  36.56 
 
 
106 aa  54.3  2e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  35.48 
 
 
172 aa  53.9  3e-06  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  34.41 
 
 
171 aa  52.4  9e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  34.41 
 
 
171 aa  52.4  9e-06  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  33.33 
 
 
171 aa  52  1e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  33.33 
 
 
145 aa  51.6  2e-05  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  32.63 
 
 
192 aa  50.1  4e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  31.25 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  33.67 
 
 
161 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  30.39 
 
 
166 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  30.21 
 
 
133 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  30.17 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  29.49 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  31.11 
 
 
146 aa  43.9  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  32.73 
 
 
148 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  28.77 
 
 
149 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  34.55 
 
 
148 aa  42.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  32.39 
 
 
149 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>