More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0034 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
758 aa  1560  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.5313e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.94 
 
 
746 aa  470  1e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
794 aa  399  1e-110  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  43.15 
 
 
696 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.75 
 
 
696 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 
744 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  32.12 
 
 
758 aa  358  3e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  31.98 
 
 
758 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 
734 aa  346  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.42 
 
 
754 aa  345  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  35.68 
 
 
670 aa  341  3e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 
741 aa  337  6e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  29.97 
 
 
738 aa  329  1e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.98 
 
 
656 aa  328  3e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.44 
 
 
737 aa  320  8e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  32.08 
 
 
752 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.41 
 
 
672 aa  314  3e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.1 
 
 
764 aa  304  3e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  32.26 
 
 
760 aa  301  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 
759 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.83 
 
 
614 aa  291  5e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.64 
 
 
694 aa  290  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.42 
 
 
658 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.02 
 
 
758 aa  288  3e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.23 
 
 
936 aa  288  3e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
756 aa  285  2e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
729 aa  281  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.89 
 
 
753 aa  281  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  27.53 
 
 
701 aa  278  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.48 
 
 
729 aa  269  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  29.47 
 
 
731 aa  266  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.66 
 
 
611 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 
665 aa  251  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 
721 aa  251  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.74 
 
 
723 aa  246  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
641 aa  240  7e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.44 
 
 
761 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
903 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.94 
 
 
723 aa  238  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  28.19 
 
 
638 aa  236  1e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 
702 aa  233  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.44 
 
 
725 aa  229  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  29.89 
 
 
717 aa  227  5e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
667 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.76 
 
 
701 aa  223  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
593 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.8 
 
 
703 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  36 
 
 
864 aa  217  6e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 
859 aa  216  1e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.54 
 
 
858 aa  210  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 
724 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.19 
 
 
757 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  35.55 
 
 
726 aa  207  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.97957e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 
643 aa  207  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.89 
 
 
678 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.34 
 
 
643 aa  201  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.85 
 
 
657 aa  199  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  35.13 
 
 
701 aa  195  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  34.41 
 
 
701 aa  195  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.58 
 
 
652 aa  194  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  25.8 
 
 
645 aa  194  5e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  33.57 
 
 
861 aa  194  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 
860 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  32.59 
 
 
735 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.6 
 
 
656 aa  191  3e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
744 aa  191  3e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  37.93 
 
 
797 aa  190  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.15 
 
 
911 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.93 
 
 
744 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.44 
 
 
712 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.18563e-06  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 
632 aa  188  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.76 
 
 
597 aa  186  1e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.02 
 
 
650 aa  186  1e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.74 
 
 
607 aa  184  5e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  35.14 
 
 
713 aa  181  5e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  29.56 
 
 
635 aa  180  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  31.05 
 
 
632 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
675 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  26.81 
 
 
582 aa  175  3e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.85352e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
681 aa  167  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.79 
 
 
648 aa  166  1e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  23.63 
 
 
753 aa  165  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 
421 aa  164  5e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
479 aa  164  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  38.58 
 
 
636 aa  163  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  9.55851e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
529 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.06 
 
 
358 aa  160  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  38.39 
 
 
651 aa  158  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 
699 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  38.81 
 
 
528 aa  154  6e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  38.25 
 
 
738 aa  154  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  30.03 
 
 
364 aa  152  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.48 
 
 
650 aa  152  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  37.39 
 
 
465 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5293  adenylate/guanylate cyclase  35.98 
 
 
421 aa  151  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0545376  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  37.91 
 
 
526 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  35.91 
 
 
441 aa  150  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  35.98 
 
 
462 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  37.56 
 
 
524 aa  150  1e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2796  adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 
447 aa  149  2e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>