More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0030 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 
1644 aa  649  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.69 
 
 
1795 aa  680  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  100 
 
 
1739 aa  3560  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.55 
 
 
1808 aa  649  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  29.68 
 
 
2361 aa  677  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.85 
 
 
1780 aa  712  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  30.14 
 
 
1934 aa  672  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  28.18 
 
 
1850 aa  642  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.25 
 
 
1797 aa  661  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  30.07 
 
 
1908 aa  683  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  29.44 
 
 
2051 aa  685  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
1942 aa  653  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
1932 aa  674  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30.44 
 
 
1833 aa  639  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  28.3 
 
 
1805 aa  674  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 
1914 aa  652  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.66 
 
 
1805 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.59 
 
 
1901 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.08 
 
 
1804 aa  628  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.56 
 
 
1845 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  27.37 
 
 
2077 aa  608  1e-172  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  30.17 
 
 
1922 aa  607  1e-172  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.99 
 
 
1663 aa  605  1e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.44 
 
 
1774 aa  604  1e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.99 
 
 
1794 aa  601  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.98 
 
 
1809 aa  597  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.39 
 
 
2017 aa  594  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  29.68 
 
 
1668 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.95 
 
 
1837 aa  590  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  29.17 
 
 
1697 aa  585  1e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  27.4 
 
 
1811 aa  572  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  29.63 
 
 
1885 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.86 
 
 
1822 aa  564  1e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  29.85 
 
 
1836 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.9 
 
 
1712 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  30.76 
 
 
2109 aa  530  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  27.48 
 
 
2272 aa  521  1e-146  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.71 
 
 
1780 aa  522  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.61 
 
 
2279 aa  514  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  27 
 
 
1871 aa  513  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.75 
 
 
2303 aa  479  1e-133  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  27.95 
 
 
1685 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.11 
 
 
1685 aa  450  1e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.66 
 
 
1797 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.94 
 
 
1885 aa  423  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  26.5 
 
 
1744 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  33.86 
 
 
670 aa  383  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.65 
 
 
1832 aa  355  4e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.04 
 
 
1710 aa  345  4e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  27.72 
 
 
1756 aa  344  9e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  24.23 
 
 
1685 aa  343  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
1637 aa  312  3e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  23.74 
 
 
1682 aa  312  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4360  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
1636 aa  309  4e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.94 
 
 
1748 aa  286  3e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48535  predicted protein  24.3 
 
 
1112 aa  279  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 
1649 aa  280  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
1726 aa  274  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
1123 aa  273  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45780  predicted protein  24.27 
 
 
1060 aa  272  3e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49028  predicted protein  26.25 
 
 
1064 aa  259  3e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 
1643 aa  249  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50614  predicted protein  24.93 
 
 
1123 aa  243  3e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.14 
 
 
1788 aa  236  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.65 
 
 
1682 aa  234  8e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4642  serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
1629 aa  224  1e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
1473 aa  219  3e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  24.57 
 
 
1473 aa  218  1e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  24.57 
 
 
1473 aa  218  1e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50602  predicted protein  24.65 
 
 
1255 aa  183  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.94407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  41.41 
 
 
384 aa  174  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  24.74 
 
 
1774 aa  168  1e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1102  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
364 aa  158  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
780 aa  153  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54547  protein kinase  22.32 
 
 
900 aa  153  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0466  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 
780 aa  145  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00551586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
513 aa  144  1e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.94 
 
 
740 aa  134  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
598 aa  132  7e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
484 aa  132  8e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0729257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0681  sensory box histidine kinase  35.34 
 
 
356 aa  131  9e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393599  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
644 aa  130  2e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0428493 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  31.33 
 
 
598 aa  130  2e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
489 aa  130  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.748441  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  33.33 
 
 
515 aa  130  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.88 
 
 
575 aa  129  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.88 
 
 
575 aa  129  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  32.05 
 
 
388 aa  129  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.43 
 
 
575 aa  129  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
359 aa  128  8e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.77 
 
 
1666 aa  127  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.09 
 
 
497 aa  127  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  36.06 
 
 
670 aa  126  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  125  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
462 aa  125  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
595 aa  125  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
594 aa  125  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  32.76 
 
 
458 aa  125  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49156  predicted protein  22.02 
 
 
1086 aa  124  2e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.402458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
421 aa  122  4e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>