More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0026 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  100 
 
 
426 aa  893    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  57.68 
 
 
425 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  57.11 
 
 
429 aa  526  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  56.81 
 
 
425 aa  527  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  54.31 
 
 
428 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  54.55 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  52.91 
 
 
427 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  53.5 
 
 
428 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  53.36 
 
 
428 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  53.49 
 
 
437 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  53.68 
 
 
425 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  51.76 
 
 
437 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  53.97 
 
 
438 aa  480  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  51.76 
 
 
463 aa  478  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  52.15 
 
 
427 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  53.05 
 
 
428 aa  476  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  51.56 
 
 
432 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  51.05 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  51.05 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  51.05 
 
 
434 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  52.8 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  51.64 
 
 
441 aa  466  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  52.07 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  49.88 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  50.47 
 
 
434 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  51.75 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  50.47 
 
 
431 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  50 
 
 
427 aa  464  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  50.7 
 
 
434 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  51.06 
 
 
429 aa  461  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  51.87 
 
 
427 aa  464  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  49.54 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  51.06 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  49.88 
 
 
432 aa  455  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  49.76 
 
 
427 aa  456  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  49.76 
 
 
436 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  49.53 
 
 
434 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  49.53 
 
 
438 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0841  type II citrate synthase  50.59 
 
 
429 aa  454  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  51.29 
 
 
436 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  51.21 
 
 
428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1678  type II citrate synthase  49.88 
 
 
431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0407476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  48.94 
 
 
425 aa  450  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  51.53 
 
 
428 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  49.18 
 
 
428 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  50.82 
 
 
431 aa  450  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  50.71 
 
 
429 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  48.13 
 
 
427 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  49.53 
 
 
428 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  49.77 
 
 
429 aa  450  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  48.95 
 
 
434 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  50.12 
 
 
429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  51.16 
 
 
431 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  48.48 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  48.71 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  48.61 
 
 
432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  49.41 
 
 
429 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  49.65 
 
 
429 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  49.65 
 
 
430 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  50 
 
 
446 aa  443  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  48.95 
 
 
427 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0599  type II citrate synthase  50.7 
 
 
430 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.281651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  48.96 
 
 
429 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  51.08 
 
 
437 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  49.65 
 
 
429 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  48.95 
 
 
435 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  48.24 
 
 
436 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  48.48 
 
 
433 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  49.53 
 
 
433 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  47.54 
 
 
434 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  49.65 
 
 
429 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  49.41 
 
 
431 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  49.3 
 
 
429 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  49.77 
 
 
434 aa  442  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  50 
 
 
429 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  49.88 
 
 
430 aa  442  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  48.95 
 
 
430 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  48.72 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  48.23 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  50.48 
 
 
428 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  48.95 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  48.83 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  48.26 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  49.3 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  50.48 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  46.73 
 
 
433 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  48.59 
 
 
430 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  48.11 
 
 
428 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  48.59 
 
 
433 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  48.03 
 
 
433 aa  435  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  50 
 
 
429 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  48.36 
 
 
433 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  49.65 
 
 
429 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  48.71 
 
 
430 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>