70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0024 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0024  phosphodiesterase  100 
 
 
163 aa  333  7e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0908  phosphodiesterase  39.76 
 
 
175 aa  104  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.808433  normal  0.308867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2746  phosphodiesterase  40.52 
 
 
176 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0763  phosphodiesterase  37.58 
 
 
168 aa  100  1e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.420804  normal  0.111199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2220  phosphodiesterase  35.5 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0660952  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0694  phosphodiesterase  37.96 
 
 
158 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2678  phosphodiesterase  40.97 
 
 
162 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0718  phosphodiesterase  37.96 
 
 
158 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.205538  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1362  phosphodiesterase  37.14 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1231  phosphodiesterase  34.91 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.234159  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1588  phosphodiesterase  37.76 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.398386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  34.03 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  34.72 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1651  hypothetical protein  35.12 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  8.44745e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  34.03 
 
 
171 aa  91.3  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0026  phosphodiesterase  32.14 
 
 
158 aa  90.5  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2093  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.43 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.253727  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1432  phosphodiesterase  36.55 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0917348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3652  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.62 
 
 
166 aa  87  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1431  phosphodiesterase  33.33 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1380  phosphodiesterase  30.77 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0138  hypothetical protein  34.51 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0185  phosphodiesterase  34.29 
 
 
164 aa  84  8e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0201  phosphodiesterase  33.53 
 
 
168 aa  82.8  2e-15  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.605154  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0530  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.97 
 
 
162 aa  77.8  5e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0060  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 
178 aa  72.8  2e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.876718  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2556  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.39 
 
 
163 aa  72.8  2e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.438723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1906  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.34 
 
 
184 aa  71.6  5e-12  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0341  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.45 
 
 
171 aa  63.2  1e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.431716  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0099  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
169 aa  60.8  7e-09  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1399  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.5 
 
 
163 aa  60.8  7e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.66731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.78 
 
 
173 aa  55.8  2e-07  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1550  phosphodiesterase  29.08 
 
 
180 aa  55.1  4e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.95 
 
 
181 aa  51.2  5e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  29.65 
 
 
161 aa  48.9  3e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.44 
 
 
178 aa  48.1  5e-05  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.16 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.07557e-06  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  25.6 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  25.6 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  28.99 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  28.99 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0572  hypothetical protein  26.43 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  25.32 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  29.5 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.25 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  32.37 
 
 
152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.33 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  28.82 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  25.47 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  31.65 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.09 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  32.8 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  31.39 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.52538e-11 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.08 
 
 
154 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.78 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.04 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.83 
 
 
162 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.75 
 
 
160 aa  41.6  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1086  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.29 
 
 
180 aa  41.6  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  28.47 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  30.43 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.08 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  26.43 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.32589e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.75 
 
 
178 aa  40.8  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30 
 
 
162 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  25.93 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>