More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0021 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.11 
 
 
224 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  42.36 
 
 
224 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38 
 
 
236 aa  142  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  37.31 
 
 
238 aa  140  2e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
232 aa  133  2e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  34.76 
 
 
210 aa  131  7e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.3 
 
 
206 aa  130  1e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.89 
 
 
212 aa  129  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 
208 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  38.17 
 
 
212 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
206 aa  120  1e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  40.44 
 
 
206 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.16 
 
 
247 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  36.07 
 
 
256 aa  111  8e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  33.01 
 
 
221 aa  104  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.82708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.16 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  30.05 
 
 
209 aa  70.9  2e-11  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.8 
 
 
254 aa  68.9  6e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
218 aa  67  2e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.22 
 
 
232 aa  65.9  4e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  31.03 
 
 
209 aa  65.9  5e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.77 
 
 
212 aa  64.3  1e-09  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.09 
 
 
227 aa  63.2  3e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.99 
 
 
218 aa  62  8e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  40.74 
 
 
237 aa  60.8  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
213 aa  60.1  2e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6257  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.12 
 
 
240 aa  60.8  2e-08  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766914 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
228 aa  60.5  2e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
220 aa  60.1  2e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
233 aa  60.1  3e-08  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  25.68 
 
 
188 aa  59.7  3e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.60736e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  25.68 
 
 
188 aa  59.7  3e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.93158e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
256 aa  59.7  3e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  25.68 
 
 
188 aa  59.7  3e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.66362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  29.57 
 
 
223 aa  59.3  4e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0642  HAD family hydrolase  26.6 
 
 
255 aa  59.3  4e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.911495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.88 
 
 
222 aa  59.3  5e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  8.22361e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.32 
 
 
211 aa  58.9  6e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  1.48872e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.53 
 
 
219 aa  58.9  6e-08  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
222 aa  58.5  7e-08  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 
461 aa  58.5  7e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  25.27 
 
 
223 aa  58.5  7e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.34 
 
 
238 aa  58.5  8e-08  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  25.56 
 
 
216 aa  58.2  9e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  24.86 
 
 
216 aa  57.8  1e-07  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.97 
 
 
209 aa  57.8  1e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  27.27 
 
 
223 aa  57.4  1e-07  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.41 
 
 
214 aa  57.8  1e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.4 
 
 
216 aa  57.4  1e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 
223 aa  57.8  1e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0571  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.03 
 
 
618 aa  57.4  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 
252 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  36.61 
 
 
214 aa  57.4  2e-07  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  27.18 
 
 
252 aa  57  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
170 aa  57  2e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
216 aa  57.4  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
219 aa  56.6  2e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  1.19514e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
239 aa  57  2e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  27 
 
 
213 aa  56.6  3e-07  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  27.07 
 
 
217 aa  56.2  3e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.30583e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.8 
 
 
216 aa  56.2  3e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
220 aa  56.2  3e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  28.79 
 
 
233 aa  56.2  3e-07  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.34 
 
 
218 aa  56.2  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.79 
 
 
227 aa  56.2  4e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  29.61 
 
 
227 aa  55.5  5e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.85 
 
 
233 aa  55.8  5e-07  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.56 
 
 
218 aa  55.5  6e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
252 aa  55.5  6e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  55.5  6e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.37 
 
 
220 aa  55.5  7e-07  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  2.56212e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
252 aa  55.5  7e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  30.81 
 
 
230 aa  55.5  7e-07  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.08 
 
 
217 aa  55.1  8e-07  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  27.75 
 
 
229 aa  55.1  9e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1715  HAD family hydrolase  42.47 
 
 
195 aa  54.7  9e-07  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.101498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
221 aa  55.1  9e-07  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
227 aa  55.1  9e-07  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
251 aa  55.1  9e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  26.6 
 
 
219 aa  55.1  9e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
252 aa  54.3  1e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  28 
 
 
262 aa  54.7  1e-06  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  28.11 
 
 
207 aa  54.7  1e-06  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
233 aa  54.7  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
224 aa  54.3  1e-06  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
241 aa  54.7  1e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  26.74 
 
 
231 aa  54.3  1e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  25.93 
 
 
219 aa  54.7  1e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.56 
 
 
226 aa  53.5  2e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
252 aa  53.9  2e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1247  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  25.54 
 
 
206 aa  53.5  2e-06  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0333154  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.84 
 
 
217 aa  53.5  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.89 
 
 
207 aa  53.9  2e-06  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 
229 aa  53.9  2e-06  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
252 aa  53.9  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.55 
 
 
252 aa  53.9  2e-06  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
254 aa  53.5  2e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  27.47 
 
 
227 aa  53.9  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.17 
 
 
233 aa  53.9  2e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>