113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0020 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  100 
 
 
488 aa  974  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0730  protein of unknown function DUF107  29.79 
 
 
828 aa  183  6e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.553992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  29.15 
 
 
436 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  30.43 
 
 
458 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  33.88 
 
 
452 aa  173  6e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  29.26 
 
 
423 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  29.1 
 
 
424 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1662  hypothetical protein  29.5 
 
 
493 aa  146  8e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.174432 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
447 aa  146  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  30.72 
 
 
424 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  27.65 
 
 
407 aa  133  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1624  protein of unknown function DUF107  31.65 
 
 
478 aa  133  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  28.31 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  27.75 
 
 
456 aa  92.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  25.37 
 
 
429 aa  90.9  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.209e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05730  hypothetical protein  29.14 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.962893  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  28.92 
 
 
443 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  27.99 
 
 
444 aa  87.4  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.76034e-09  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  25.86 
 
 
438 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  27.1 
 
 
489 aa  85.9  1e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1742  protein of unknown function DUF107  24.1 
 
 
462 aa  85.5  2e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0102804 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1661  nfeD family protein  27.68 
 
 
458 aa  85.5  2e-15  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.125508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1634  hypothetical protein  25.07 
 
 
459 aa  84  5e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  24.73 
 
 
454 aa  82.8  1e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3548  hypothetical protein  26.89 
 
 
453 aa  83.2  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0969305  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0465  hypothetical protein  25.11 
 
 
451 aa  83.2  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00378615  normal  0.0107416 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0527  non-proteolytic membrane spanning protein, peptidase family S49  26.96 
 
 
458 aa  82.4  2e-14  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  27.23 
 
 
458 aa  80.5  6e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  24.74 
 
 
437 aa  80.1  8e-14  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  26.15 
 
 
464 aa  79.7  1e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  26.82 
 
 
462 aa  79.7  1e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  24.32 
 
 
496 aa  78.6  2e-13  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  25.14 
 
 
446 aa  77.4  5e-13  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  27.54 
 
 
464 aa  77.4  5e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05880  putative membrane-bound protease  28.89 
 
 
443 aa  76.6  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5124  hypothetical protein  27.7 
 
 
508 aa  76.6  1e-12  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417825 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  26.82 
 
 
491 aa  75.9  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3654  hypothetical protein  27.93 
 
 
524 aa  75.9  1e-12  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06173  serine protease  24.38 
 
 
455 aa  75.9  2e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  26.14 
 
 
433 aa  75.1  2e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  25.12 
 
 
463 aa  73.9  6e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  25.33 
 
 
423 aa  73.6  8e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2176  nodulation efficiency protein D  27.09 
 
 
560 aa  72.4  2e-11  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1082  hypothetical protein  25.33 
 
 
546 aa  71.6  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409123  hitchhiker  0.00827512 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0916  NfeD family protein  26.42 
 
 
503 aa  70.9  5e-11  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.654023  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0824  NfeD family protein  27.04 
 
 
501 aa  70.5  7e-11  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.826176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1023  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  26.04 
 
 
529 aa  70.1  8e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0224  hypothetical protein  27.62 
 
 
447 aa  69.7  1e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  25.99 
 
 
437 aa  69.3  2e-10  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0553  putative lipoprotein  28.77 
 
 
443 aa  68.9  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0471  nodulation efficiency protein NfeD  28.46 
 
 
481 aa  68.6  2e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  28.8 
 
 
488 aa  68.2  3e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  26.27 
 
 
557 aa  68.2  4e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  27.51 
 
 
488 aa  67.4  5e-10  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  24.74 
 
 
473 aa  67.4  6e-10  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1169  protein of unknown function DUF107  24.79 
 
 
434 aa  66.6  8e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0123968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  26.96 
 
 
460 aa  67  8e-10  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3402  hypothetical protein  27.4 
 
 
519 aa  66.6  1e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4965  hypothetical protein  27.4 
 
 
519 aa  66.6  1e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5321  hypothetical protein  26.55 
 
 
516 aa  66.2  1e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00956153  decreased coverage  0.00774804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0712  membrane-bound serine protease  26.97 
 
 
525 aa  65.5  2e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0268  hypothetical protein  28.46 
 
 
449 aa  64.7  3e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2887  hypothetical protein  26.16 
 
 
501 aa  63.9  6e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  26.44 
 
 
465 aa  63.9  7e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3029  hypothetical protein  26.16 
 
 
501 aa  63.2  9e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  25.96 
 
 
446 aa  62.8  1e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  2.23757e-07 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  23.76 
 
 
453 aa  62.8  1e-08  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1959  membrane-bound serine protease (ClpP class), putative  27.58 
 
 
470 aa  62.8  1e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  24.78 
 
 
439 aa  62.4  2e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1642  membrane-bound serine protease (ClpP class)  26.11 
 
 
455 aa  62.4  2e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.068778  normal  0.0912481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1160  nodulation efficiency protein NfeD  28.82 
 
 
445 aa  62.4  2e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00735841  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  25.55 
 
 
488 aa  62.4  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4387  hypothetical protein  27.62 
 
 
525 aa  62  3e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.98413  normal  0.116694 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0803  hypothetical protein  25.92 
 
 
470 aa  60.5  8e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  25.34 
 
 
442 aa  60.1  9e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0221  hypothetical protein  26.42 
 
 
448 aa  59.3  2e-07  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0200  hypothetical protein  26.09 
 
 
448 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1572  hypothetical protein  27.22 
 
 
498 aa  59.3  2e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0990  hypothetical protein  24.03 
 
 
453 aa  58.5  2e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.781723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1477  hypothetical protein  25.66 
 
 
436 aa  58.2  3e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135375  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4390  protein of unknown function DUF107  25.48 
 
 
467 aa  57.8  4e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  23.58 
 
 
430 aa  56.6  9e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4906  hypothetical protein  27.73 
 
 
528 aa  56.2  1e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.349599 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  27.25 
 
 
452 aa  56.2  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  26.42 
 
 
425 aa  55.5  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2658  hypothetical protein  24.92 
 
 
501 aa  55.8  2e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.853599  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1306  NfeD protein  26.64 
 
 
443 aa  55.1  3e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  24.79 
 
 
500 aa  54.3  5e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  32.05 
 
 
510 aa  53.9  7e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  25.88 
 
 
467 aa  52.8  1e-05  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1515  hypothetical protein  24.45 
 
 
486 aa  52.4  2e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.331785  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0864  protein of unknown function DUF107  25.95 
 
 
447 aa  52  3e-05  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0908581  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5652  protein of unknown function DUF107  29.66 
 
 
522 aa  52  3e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.995494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0014  hypothetical protein  26.03 
 
 
427 aa  51.2  4e-05  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  32.38 
 
 
454 aa  50.4  7e-05  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  50.4  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  27.88 
 
 
235 aa  50.4  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1056  hypothetical protein  27.33 
 
 
438 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.919893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  31.71 
 
 
158 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1495  protein of unknown function DUF107  26.2 
 
 
471 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>