17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0019 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0019  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  300  7e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.07386e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2900  protein of unknown function DUF107  34.87 
 
 
158 aa  66.6  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0230935  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1818  hypothetical protein  34.59 
 
 
424 aa  65.5  3e-10  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163142  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2227  protein of unknown function DUF107  35.34 
 
 
424 aa  63.5  1e-09  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.46745  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1572  hypothetical protein  30.07 
 
 
436 aa  60.5  1e-08  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.951288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1193  protein of unknown function DUF107  26.97 
 
 
458 aa  59.7  2e-08  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0874985  normal  0.16265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  36.7 
 
 
423 aa  54.3  6e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1141  hypothetical protein  32.61 
 
 
236 aa  54.3  7e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2489  hypothetical protein  45.9 
 
 
171 aa  53.5  1e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.14918e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1666  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  52  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1632  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  52  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0326  protein of unknown function DUF107  28.86 
 
 
206 aa  50.1  1e-05  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0124428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0857  hypothetical protein  36.84 
 
 
163 aa  49.7  1e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0020  hypothetical protein  37.66 
 
 
488 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0391  protein of unknown function DUF107  39.71 
 
 
452 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1190  protein of unknown function DUF107  29.47 
 
 
447 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00806251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2844  serine protease, ClpP class  38.1 
 
 
407 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>